一种基因多序列比对方法、设备和系统.pdf
高格****gu
在线预览结束,喜欢就下载吧,查找使用更方便
相关资料
一种基因多序列比对方法、设备和系统.pdf
本发明属于生物信息学技术领域,具体涉及一种基因多序列比对方法、设备和系统。本发明的基因多序列比对方法包括如下步骤:步骤1,设置模板信息,所述模板信息包括待分析基因的模板序列、保守基序位置和保守基序长度;步骤2,根据步骤1的模板信息作为参照,对待分析序列进行校正和多序列全局比对,形成数据集。本发明还提供应用上述基因多序列比对方法的设备和系统。本发明的技术方案能够大大减少基因多序列比对的工作量,显著提高多序列比对工作的效率。因此,具有很好的应用前景。
功能基因的序列比对方法.pdf
功能基因的序列比对<1>.切除载体和(或)引物a.翻开所有的原始引物序列于一个EditSeq的窗口中b.exportallasonec.保存d.翻开这个保存的文件,开始切除载体和引物e.选择载体插入点两侧的序列(10-15个的样子)搜索注意:不存在正反向的问题,都是一个方向,因为测序的时候是选择两个载体上的引物其中的一条来往后测序的!切完之后另存为f.重新翻开这个文件,开始切除引物方法同切载体,但是要注意正反向的问题。比方mcrA基因,其引物为Forward:5'-GGTGGTGTMGGATTCACACA
多序列比对.ppt
多序列比对(MultipleAlignments)寻找蛋白质家族,识别多个序列的保守区域相似的蛋白质序列往往具有相似的结构与功能辅助预测新序列的二级或三级结构可以直观地看到基因的哪些区域对突变敏感PCR引物设计分析多个序列的一致序列用于进化分析,是用系统发育方法构建进化树的初使步骤寻找个体之间单核苷酸多态性(SNPs)通过序列比对发现直系同源(Orthologs)与旁系同源(Paralogs)基因寻找同源基因(相似的序列往往具有同源性)多序列比对与进化研究例子一个多序列比对例子多序列比对方法在多序列比对前
针对基因选择性剪接的多序列比对算法研究.pdf
清华大学学报(自然科学版)年第卷第期ISSN100020054200141928ö32CN1122223öNJTsinghuaUniv(Sci&Tech),2001,Vol.41,No.91112114针对基因选择性剪接的多序列比对算法研究计宏凯,周晴,闻芳,季梁(清华大学自动化系,北京100084)摘要:为对真核基因的选择性剪接形式进行准确、快速、义。多序列比对是进行上述研究的重要工具[1~5]。本有效的研究,提出了一种启发式多序列比对算法。该算法借文提出了一种针对基因选择性剪接的多序列比对算助引导树启
基于Yarn云平台的生物基因多序列比对并行算法.docx
基于Yarn云平台的生物基因多序列比对并行算法标题:基于Yarn云平台的生物基因多序列比对并行算法摘要:生物基因多序列比对是一种关键的生物信息学任务,旨在找到多个生物基因序列之间的相似性和差异性。然而,随着基因组数据的不断增多和计算量的不断增加,传统的串行比对算法已经无法满足高效和准确的比对需求。为此,本论文提出了基于Yarn云平台的生物基因多序列比对并行算法。引言:随着高通量测序技术的发展,生物基因组学研究中生成的序列数据量大幅增加,导致了生物基因多序列比对任务的巨大计算压力。传统的串行比对算法,如Sm