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本发明公开了一种基于多模型融合的水下视频目标尺度空间判别式跟踪系统及方法,涉及水下机器人、视频目标跟踪领域,步骤包括:1、多传感器配准;2、采用基于YOLO检测模型和高斯混合检测模型的多模型融合检测算法对目标进行检测;3、输入尺度空间判别式跟踪器进行跟踪,获得所述目标的相对位置和尺度信息;4、计算目标在水下多传感器检测跟踪系统的位置信息和尺度信息;5、使用无迹卡尔曼滤波器对目标位置信息进行滤波,得到最终的目标状态和运动轨迹。本发明可提升深海复杂环境下,视频目标检测跟踪的准确性、稳定性和有效性。