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本发明公开了一种医学图像超体素分割方法和装置,所述方法包括以下步骤:基于DICOM文件获取待分割组织结构的三维体数据和所述体数据中每个体素的密度值;将所述三维体数据预分割为多个正方体,初始化种子点;对于每个种子点,根据所述密度和位置信息,计算所述种子点和其他体素之间的基于密度?位置约束的测地距离;根据所述基于密度?位置约束的测地距离,采用快速行进法确定所有体素的分类标签,完成所述三维体数据的分割。本发明的超体素分割方法相对于现有技术,分割精度和效率均有显著提高。