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本发明基于频域声能流瞬时相位差加权的水下目标DOA估计方法:1、提取低频信息,离散化处理;对三通道离散信号进行FFT分析,将声压通道分别与二维矢量振速通道共轭互谱,提取频域声能流的瞬时相位;2、重复M次步骤1,更新得到M条接收信号,按顺序,计算频域声能流在X、Y轴分量上各频率单元的瞬时相位差值;3、根据计算结果,对所有频率单元的瞬时相位差值进行方差计算;4,对X、Y轴声能流分量的瞬时相位差值的方差进行平均拟合与均值滤波;5、将计算结果的倒数作为权值,分别对频域声能流各分量下所有频率单元进行瞬时相位差的方差加权,得到频域声能流;6、提取频域声能流分量实部,计算每个频点声能流并进行统计,得到目标方位。