用于低血浆起始量、低频突变检测的方法、试剂盒及其应用.pdf
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用于低血浆起始量、低频突变检测的方法、试剂盒及其应用.pdf
本发明提出用于低血浆起始量、低频突变检测的方法、试剂盒及其应用,其中,包括一种高通量测序文库的构建方法:1)对提取后cfDNA进行末端修复;2)对末端修复产物进行接头连接;3)对接头连接产物进行第一次磁珠纯化;4)对第一纯化产物进行扩增得到扩增产物;5)对扩增产物进行第二次磁珠纯化得到预文库;6)利用所述单个预文库进行混合处理;7)利用步骤6)获得的混合预文库配置杂交反应体系,并进行杂交处理;8)将步骤7)获得的杂交产物进行特异性捕获,以便获得捕获文库;9)将所述捕获文库进行扩增及第三次磁珠纯化处理,得到
低起始量血浆游离DNA甲基化建库试剂盒及方法.pdf
本发明公开了一种酶法甲基化建库方法,该方法通过TET酶甲基化处理,一定程度地降低甲基化建库过程中DNA的损伤,从而降低核酸样品中DNA的投入量要求;此外,进一步配合本发明的末端修复和加A反应一步试剂,能够实现一管建库,减少纯化步骤;进一步配合本发明的DNA连接酶增强液,能够提高连接效率,提高建库质量和测序质量;并且本发明方法建库起始量低,DNA投入量可低至1ng,适于包括cfDNA在内的微量建库。
低频突变检测方法、试剂盒和装置.pdf
本发明提出了一种测序接头,所述测序接头呈Y字型,包括:第一链,所述第一链包括相连的第一样本标签序列和第一分子标签序列;以及第二链,所述第二链包括相连的第二样本标签序列和第二分子标签序列。由此,利用本发明的测序接头能够有效地构建基因组DNA样品的高通量测序文库,特别是能够有效地构建适用于检测低频突变的高通量测序文库,通过对文库的测序,然后基于对测序结果的数据分析,以获得序列信息,实现高效、准确、快速地对基因组DNA样品的检测,适于广泛应用。
一种检测肺癌血浆游离目标DNA多位点低频突变的方法和试剂盒.pdf
本发明涉及生物技术领域及核酸检测领域,涉及检测肺癌血浆游离目标DNA多位点低频突变的方法及其试剂盒。本发明提供了高灵敏度和高通量的用于一次性检测肺癌血浆游离DNA多位点突变的方法及试剂盒。该检测方法结合ddPCR及二代测序技术对肺癌ctDNA突变进行检测,包括步骤:1)数字PCR混合液制备,包括待测样品DNA模板、引物及PCR预混液;2)制作数字PCR微反应液滴,进行PCR扩增反应;3)PCR产物的回收与纯化;4)二轮PCR混合液制备及扩增;5)PCR产物纯化及文库质控,6.上机测序及数据分析;可一次性检
一种用于检测靶基因是否发生融合突变的方法、引物组合、试剂盒及其应用.pdf
本发明涉及一种设计用于检测靶基因是否发生融合突变的引物组合的方法、引物组合、试剂盒及其应用。本发明所述引物设计方法沿可能的基因融合发生方向依次设计多条引物,组成引物组合,所述引物组合的引物沿基因融合发生的方向延伸,能够对发生未知融合的靶基因进行定向富集,克服现有扩增子测序方法无法靶向富集未知融合基因的缺点,有利于基因未知融合类型的发现和检测;同时,相邻两个引物之间的间隔为约0~130bp,对高度片段化的样本(如cfDNA、FFPE样本)的富集效果好。本发明还针对肺癌基因融合突变(包括ALK基因、NTRK1