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本发明提供了一种基于无人机影像分析的赤潮区域确定方法、存储介质和电子设备,所述方法包括以下步骤:根据无人机拍摄的图像信息提取赤潮子区域边界像素点;根据无人机拍摄图像信息对应的拍摄参数信息进行坐标转换,将无人机拍摄的图像信息转换至物方坐标系下;在物方坐标系下确定赤潮子区域边界像素点的三维坐标位置,并基于赤潮子区域边界像素点的三维坐标位置确定赤潮子区域;将多张基于无人机拍摄的图像信息确定的赤潮子区域进行合并,得到最终的赤潮区域。上述方案通过对无人机拍摄图像进行解析,能够准确地分析出当前赤潮区域并标记其对应的三维坐标位置,从而实现对赤潮区域的有效监测。