基于序列特征的固有无序蛋白结合位点的统计分析本科毕业论文设计.doc

德州学院物电学院2014届应用物理学专业毕业论文PAGE\*MERGEFORMAT23基于序列特征的固有无序蛋白结合位点的统计分析xxx（物理与电子信息学院，山东德州253023）摘要本文以Disprot和BSDP数据库中的固有无序蛋白的结合位点为研究对象，构建9种结合位点数据集，利用MATLAB进行统计结合位点各种氨基酸的频率，结果发现，蛋白质与蛋白质相互作用的结合位点最多，蛋白质与ATP/GTP相互作用的结合位点最少，而且还可以得知各种类型结合位点的氨基酸具有明显的偏好性。该研究有助于认识固有无序蛋白质与其它成份的相互作用特征、为进一步挖掘固有无序蛋白质的序列特征，进而为发展预测固有无序蛋白质与蛋白质、DNA、RNA、配体、辅因子等物质结合位点的软件奠定了良好的基础。关键词固有无序蛋白；无序区；序列分析；结合位点1引言1.1固有无序蛋白质蛋白质是构成生物体最重要的两类大分子之一，蛋白质翻译在整个生物过程中发挥着非常重要的作用。传统思想认为，蛋白质要实现生物功能，必须先折叠成一个稳定的三维结构，因此形成了蛋白质结构决定其功能的主流观点，对蛋白质科学的研究已经取得了一系列成就，创造了现代蛋白质科学的“大爆炸”时代ADDINEN.CITE<EndNote><Cite><Author>Uversky</Author><Year>2002</Year><RecNum>16</RecNum><record><rec-number>16</rec-number><foreign-keys><keyapp="EN"db-id="d9ee0zdenxfwe5eswdux2xxextt9v9eetx02">16</key></foreign-keys><ref-typename="JournalArticle">17</ref-type><contributors><authors><author>Uversky,V.N.</author></authors></contributors><auth-address>InstituteforBiologicalInstrumentation,RussianAcademyofSciences,142292Pushchino,MoscowRegion,[e-mail]</auth-address><titles><title>Nativelyunfoldedproteins:apointwherebiologywaitsforphysics</title><secondary-title>ProteinSci</secondary-title></titles><periodical><full-title>ProteinSci</full-title></periodical><pages>739-56</pages><volume>11</volume><number>4</number><edition>2002/03/23</edition><keywords><keyword>Databases,Factual</keyword><keyword>Models,Chemical</keyword><keyword>PhysicalPhenomena</keyword><keyword>Physics</keyword><keyword>ProteinConformation</keyword><keyword>ProteinFolding</keyword><keyword>Proteins/*chemistry</keyword></keywords><dates><year>2002</year><pub-dates><date>Apr</date></pub-dates></dates><isbn>0961-8368(Print)&#xD;0961-8368(Linking)</isbn><accession-num>11910019</accession-num><urls><related-urls><url>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&amp;db=PubMed&amp;dopt=Citation&amp;list_uids=11910019</url></related-urls></urls><custom2>2373528</custom2><electronic-resource-num>10.1110/ps.4210102</electronic-resource-num><language>eng</language><