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TCGA癌症数据库介绍专题培训课件.ppt

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目录TCGA-theCancergenomeATLAS癌症种类丰富，样本量大34kindsofcancer325samplesonaverageTCGA数据的产生历程：1.组织样本和临床数据来源网站(TSS)收集的数据发送到Biospecimen核心资源(BCRs)。2.BCRs提交临床数据和元数据到数据协调中心(DCC)和测序中心(GSCs),获取组织变异数据,然后提交给DCC。3.GSCs提交跟踪文件,序列比对后文件到癌症基因组学中心(CGHub)。4.提交给DCC和CGHub的数据可供研究团队和基因组数据分析中心(GDACs)使用。5.分析pipeline以及由GDACs产生的数据结果通过DCC保存到研究社区（community）中。详细请见：https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/TCGA+barcode注意：低水平的测序数据存储在CGHubhttps://cghub.ucsc.edu/,申请下载时需要DUNSnumber.TheCancerGenomicsHub(CGHub)isasecurerepositoryforstoring,cataloging,andaccessingcancergenomesequences,alignments,andmutationinformationfromtheCancerGenomeAtlas(TCGA)consortiumandrelatedprojects.癌症种类丰富，样本量大34kindsofcancer325samplesonaverage21最简单的方法：临床数据解读