基于生物云平台的微生物多样性分析方法及系统.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN105447336A(43)申请公布日2016.03.30(21)申请号201511017526.1(22)申请日2015.12.29(71)申请人北京百迈客生物科技有限公司地址101300北京市顺义区南法信府前街12号顺捷大厦5层(72)发明人郑洪坤孔关义杨男(74)专利代理机构北京路浩知识产权代理有限公司11002代理人李相雨(51)Int.Cl.G06F19/10(2011.01)权利要求书2页说明书6页附图6页(54)发明名称基于生物云平台的微生物多样性分析方法及系统(57)摘要本发明公开一种基于生物云平台的微生物多样性分析方法及系统，能够提高微生物多样性分析的效率。方法包括：从云端数据库中获取用户指定的路径对应的测序数据；利用所述路径和预设的参数生成配置文件和任务执行命令；基于所述任务执行命令，利用所述配置文件对所述测序数据进行基本分析，并在基本分析结束后，将基本分析的结果以报告和/或图表的形式进行展示。CN105447336ACN105447336A权利要求书1/2页1.一种基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，包括：用户界面模块、请求分析模块、综合分析模块和图表呈现模块；其中，所述用户界面模块，用于根据用户的操作生成用户请求，并将所述用户请求发送给所述请求分析模块，其中，所述用户请求中包括用户指定的参数，从云端数据库中获取用户指定的测序数据的第一请求信息，以及对所述测序数据进行分析的第二请求信息，所述第一请求信息中包括所述测序数据的路径，所述请求分析模块，用于接收所述用户请求，通过对所述用户请求进行解析，得到所述参数、第一请求信息和第二请求信息，基于所述第二请求信息，利用所述参数和所述第一请求信息中的测序数据的路径生成配置文件和任务执行命令，基于所述第一请求信息，利用所述第一请求信息中的测序数据的路径，从云端数据库中获取所述路径对应的测序数据，并将所述配置文件、任务执行命令和测序数据发送给所述综合分析模块，其中，所述云端数据库中存储有所述测序数据，所述综合分析模块，用于接收所述配置文件、任务执行命令和测序数据，基于所述任务执行命令，利用所述配置文件对所述测序数据进行基本分析，得到基本分析的结果，将所述基本分析的结果存储至所述云端数据库中，并在基本分析结束后生成基本分析结束的标志性文件，所述图表呈现模块，用于搜索基本分析结束的标志性文件，并在搜索到所述基本分析结束的标志性文件时，从所述云端数据库中获取所述基本分析的结果，并将所述基本分析的结果以报告和/或图表的形式进行展示。2.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，还包括：个性化分析模块；其中，所述个性化分析模块，获取所述基本分析的结果，对所述基本分析的结果进行个性化分析，得到个性化分析的结果，将所述个性化分析的结果存储至所述云端数据库中，并在个性化分析结束后生成个性化分析结束的标志性文件，所述图表呈现模块，还用于搜索个性化分析结束的标志性文件，并在搜索到所述个性化分析结束的标志性文件时，从所述云端数据库中获取所述个性化分析的结果，并将所述个性化分析的结果以报告和/或图表的形式进行展示。3.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，所述综合分析模块，用于对所述测序数据进行数据评估、OTU聚类和分类学分析、样品/组间OTU比较、物种注释及分类学分析、Apha多样性分析、Beta多样性分析和/或组间物种差异性分析。4.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，所述综合分析模块在对所述测序数据进行分析的不同阶段，从其存储的分析软件中选取相应的分析软件对所述测序数据进行分析。5.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，所述报告的格式为xml。6.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，所述综合分析模块，还用于将所述基本分析的结果通过所述请求分析模块传输给所述云端数据2CN105447336A权利要求书2/2页库所在的云端服务器，以使所述云端服务器将所述基本分析的结果存储至所述云端数据库，所述请求分析模块，还用于接收用户通过所述图表呈现模块发送的下载指令，根据所述下载指令将所述图表呈现模块显示的基本分析结果从所述云端数据库中以压缩文件的形式进行下载。7.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，所述压缩文件的格式为zip格式。8.根据权利要求1所述的基于生物云平台的微生物多样性分析系统，其特征在于，所述用户界面模块为网页WEB图形化用户界面模块。9.一种基于生物云平台的微生物多样性分析方法，其特征在于，包括：从云端