一种单分子定位装置.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN110889825A(43)申请公布日2020.03.17(21)申请号201911012189.5(22)申请日2015.08.07(62)分案原申请数据201510483297.62015.08.07(71)申请人深圳市真迈生物科技有限公司地址518000广东省深圳市罗湖区清水河街道清水河一路116号深业进元大厦2座5楼、6楼(72)发明人葛良进曾健明曾立董(51)Int.Cl.G06T7/00(2017.01)G06T7/66(2017.01)权利要求书1页说明书9页附图5页(54)发明名称一种单分子定位装置(57)摘要本发明实施例公开了一种单分子定位装置，包括：确定模块，用于针对目标图片的每一像素点，确定与所述像素点对应的亮度值矩阵，所述亮度值矩阵为以所述像素点的亮度值为中心的拥有预设行数以及预设列数的像素点亮度值的矩阵；获取模块，用于根据所述亮度值矩阵，获取所述目标图片的二值化矩阵；所述确定模块，还用于从所述二值化矩阵中确定顶点值为1的第一连通分量；计算模块，用于通过预设算法求取所述第一连通分量的中心坐标作为单分子的二维位置坐标。可见，本发明实施例能够对单分子进行定位。CN110889825ACN110889825A权利要求书1/1页1.一种单分子定位装置，其特征在于，所述单分子定位装置包括：确定模块，用于针对目标图片的每一像素点，确定与所述像素点对应的亮度值矩阵，所述亮度值矩阵为以所述像素点的亮度值为中心的拥有预设行数以及预设列数的像素点亮度值的矩阵；获取模块，用于根据所述亮度值矩阵，获取所述目标图片的二值化矩阵；所述确定模块，还用于从所述二值化矩阵中确定顶点值为1的第一连通分量；计算模块，用于通过预设算法求取所述第一连通分量的中心坐标作为单分子的二维位置坐标。2.根据权利要求1所述的单分子定位装置，其特征在于，所述获取模块包括：第一计算单元，用于计算每一所述亮度值矩阵与预设矩阵的相似度值，得到相似度值矩阵；比较单元，用于将所述相似度值矩阵中的每一相似度值与预设阈值进行比较，得到与每一所述相似度值对应的比较结果；二值化单元，用于根据所述比较结果对所述相似度值矩阵中的每一相似度值进行二值化处理，以得到所述目标图片的二值化矩阵。3.根据权利要求2所述的单分子定位装置，其特征在于，所述二值化单元具体用于：针对所述相似度值矩阵中的每一相似度值，当所述相似度值对应的比较结果为所述相似度值大于或等于所述预设阈值时，将所述相似度值二值化为1，当所述相似度值对应的比较结果为所述相似度值小于所述预设阈值时，将所述相似度值二值化为0，以得到所述目标图片的二值化矩阵。4.根据权利要求2或3所述的单分子定位装置，其特征在于，所述单分子定位装置还包括：第一接收模块，用于在所述确定模块针对目标图片的每一像素点，确定与所述像素点对应的亮度值矩阵之前，接收用户输入的阈值设置指令，所述阈值设置指令携带阈值；第一设置模块，用于响应所述阈值设置指令，将所述阈值设置指令携带的阈值设置为预设阈值。5.根据权利要求1～3任意一项所述的单分子定位装置，其特征在于，所述计算模块包括：确定单元，用于从所述第一连通分量中确定顶点数量大于预设数量的连通分量作为目标连通分量；第二计算单元，用于通过预设算法求取所述目标连通分量的中心坐标作为单分子的二维位置坐标。6.根据权利要求1～3任意一项所述的单分子定位装置，其特征在于，所述预设算法包括质心法和高斯拟合法中的任意一种，所述单分子定位装置还包括：输出模块，用于在所述计算模块通过预设算法求取所述第一连通分量的中心坐标作为单分子的二维位置坐标之前，输出定位算法选择界面；第二接收模块，用于接收用户通过所述定位算法选择界面输入的定位算法选择指令；第二设置模块，用于响应所述定位算法选择指令，将所述定位算法选择指令选择的质心法或高斯拟合法设置为预设算法。2CN110889825A说明书1/9页一种单分子定位装置技术领域[0001]本发明涉及计算机技术领域，尤其涉及一种单分子定位装置。背景技术[0002]近年来，超分辨荧光成像技术实现了在分子水平下对活细胞精细结构的观察，成为生物结构和功能成像极其重要的工具，并成为单分子测序技术必不可少的一部分。超分辨荧光成像技术是以纳米级的空间分辨率直观地显示单分子的空间分布情况的技术。超分辨荧光成像能用来研究被荧光分子标记的单分子之间的相互作用过程，可用于单分子测序技术中判断碱基的延伸情况。目前常用的超分辨荧光成像方法是利用荧光分子本身的开关效应来进行定位的显微成像技术。例如，光敏定位显微(PALM)、随机光学重建显微(STORM)等等，它们在不同时刻获取稀疏分布的被荧光分子标记的单分子的定位信息，然后将不同时刻获得的定