一种分子优化方法、系统、终端设备及可读存储介质.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN112735540A(43)申请公布日2021.04.30(21)申请号202011504557.0(22)申请日2020.12.18(71)申请人深圳先进技术研究院地址518055广东省深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号(72)发明人吴红艳纪超杰蔡云鹏郑奕嘉(74)专利代理机构北京市诚辉律师事务所11430代理人范盈(51)Int.Cl.G16C20/50(2019.01)G06F30/27(2020.01)G06N3/04(2006.01)G06F111/04(2020.01)权利要求书2页说明书10页附图2页(54)发明名称一种分子优化方法、系统、终端设备及可读存储介质(57)摘要本申请属于数据合成技术领域，特别是涉及一种分子优化方法、系统、终端设备及可读存储介质。现有的方法均将分子优化任务作为一个统一的步骤(如，不断迭代的加点(原子)和加边(化学键))，如此则会导致分子优化过程中错误的不断累积。本申请提供了一种分子优化方法，所述方法包括：获取源分子，根据目标分子对所述源分子进行裁剪获得源分子保留区域，所述源分子保留区域为所述源分子与所述目标分子的共同分子子结构；将所述源分子和所述源分子保留区域转换为联合树一，所述联合树一为所述目标分子中非共同分子子结构部分的联合树表示；将所述源分子保留区域与所述联合树一拼接获得所述目标分子。大大减少错误的传递现象。CN112735540ACN112735540A权利要求书1/2页1.一种分子优化方法，其特征在于：所述方法包括：获取源分子，根据目标分子对所述源分子进行裁剪获得源分子保留区域，所述源分子保留区域为所述源分子与所述目标分子的共同分子子结构；将所述源分子和所述源分子保留区域转换为联合树一，所述联合树一为所述目标分子中非共同分子子结构部分的联合树表示；将所述源分子保留区域与所述联合树一拼接获得所述目标分子。2.如权利要求1所述的分子优化方法，其特征在于：所述裁剪包括：解析所述源分子的待裁剪区域，根据所述带裁剪区域确定裁剪中心，根据所述裁剪中心确定裁剪分支，对所述裁剪分支进行裁剪获得所述源分子保留区域。3.如权利要求2所述的分子优化方法，其特征在于：所述解析所述源分子的待裁剪区域包括：遍历所述源分子中的节点一，遍历所述目标分子中的节点二，所述节点一与所述节点二的化学元素相同；遍历节点一的分支一得到第一分支，遍历节点二的分支二得到第二分支，所述第一分支与所述第二分支相同，将所述第一分支或者第二分支中节点数进行记录；取节点数中数值最大的所述节点一，所述第一分支为保留区域；所述第一分支以外的分支为待裁剪区域。4.如权利要求3所述的分子优化方法，其特征在于：所述确定裁剪中心包括：获取所述节点一的向量表示一；对所述向量表示一进行聚合得到所述源分子的向量表示二；结合所述向量表示一与所述向量表示二预测所述节点一作为所述裁剪中心的概率，对所述节点数进行归一化处理得到节点概率分布，所述节点概率分布数值最大的节点为所述裁剪中心。5.如权利要求4所述的分子优化方法，其特征在于：所述确定裁剪分支包括：获取分支三的向量表示三，所述分支三为所述剪裁中心的分支，通过所述向量表示一、所述向量表示三和所述第一分支的向量表示预测所述分支三的裁剪概率，对所述分支三的裁剪与否做出决策。6.如权利要求1所述的分子优化方法，其特征在于：将所述源分子和所述源分子保留区域转换为联合树一包括：将所述源分子转换为联合树二，将所述源分子保留区域转换为联合树三；对所述源分子进行编码得到节点向量表示一，对所述源分子保留区域进行编码得到节点向量表示二，对所述联合树二进行编码得到树节点向量表示二，对所述联合树三进行编码得到树节点向量表示三；将所述节点向量表示一、所述节点向量表示二、所述树节点向量表示二和所述树节点向量表示三进行树解码转换为所述联合树一。7.如权利要求1所述的分子优化方法，其特征在于：将所述源分子保留区域与所述联合树一拼接获得所述目标分子，包括：将所述联合树一转换为分子图；将所述分子图与所述源分子保留区域拼接获得所述目标分子。8.一种分子优化系统，其特征在于：所述系统包括分子剪裁单元、生成单元和分子拼接2CN112735540A权利要求书2/2页单元；所述分子剪裁单元，用于确定源分子保留区域，所述源分子保留区域为所述源分子与所述目标分子的共同分子子结构；所述生成单元，用于将所述源分子和所述源分子保留区域转换为联合树一，所述联合树一为所述目标分子中非共同分子子结构部分的联合树表示；所述分子拼接单元，用于将所述源分子保留区域与所述联合树一拼接获得所述目标分子。9.一种终端设备，包括存储器、处理器以及存储在所述存储器中并可在所述处理器上运行的计算机程序