生物信息学应用.ppt

生物信息学及其应用生物信息学的概念1生物信息学的概念2生物信息学的产生背景元素周期表的发现奠定了二十世纪物理、化学研究和发展的基础G生物信息学发展阶段生物信息学的发展趋势生物信息学在分子生物技术中的应用生物信息与精准医学精准医学线路图肿瘤个体化诊疗的全平台建设生物信息学数据库核酸研究（NAR）上收录的2000-2009年生物数据库数量增长趋势生物信息学数据库特点全球生物学数据库数据库分类一次数据库二次数据库特点比较基因组数据库模式生物human序列数据库结构数据库二次数据库二次数据库二次数据库综合数据库——国家基因库CNGBTheCancerGenomeAtlas（TCGA，https://tcgadata.nci.nih.gov/tcga）与癌症的发生和发展相关的分子突变图谱
EuropeanGenome-phenomeArchive（EGA，https：//ega.crg.eu）多种测序以及分型数据，如基因组关联分析、分子诊断
CancerGenomeAnatomyProject（CGAP，http://cgap.nci.nih.gov）收集了正常组织、前癌组织以及癌细胞的基因表达水平，以期改善癌症的检测、诊断以及病患治疗
数据库专业组织国际著名的生物信息中心ExPASy网络资源http://cn.expasy.org/国内部分生物信息学服务器NCBI----为分子生物学数据库及软件提供国际化的信息资源计算生物学分部NCBI科研人员组成NCBI结构组成图生物信息学网站的使用以NCBI为例数据库资源概览数据库资源概览数据库资源概览单一信息查询
在某一个数据库中进行一类信息查询（序列、结构、文献等）
多信息查询
同时在多个数据库中进行信息查询（核酸，蛋白，结构，高通量数据库等）
综合信息查询
在一个数据库中查询相关的多种信息（GENE、GEO等）关键词
ACCESSION
GeneSymbol
ProteinName
AuthorName
JournalTitle
E.CNumber
Organism
。。。。。。Gene数据库综合信息查询实例NCBI主页查询结果Vinmentin在Gene数据库的记录Vinmentin在核酸数据库的Genbank格式记录Vinmentin在核酸数据库的FASTA格式记录数据库资源概览数据提交数据库资源概览数据库资源概览数据库资源概览基因表达分析GEO是NCBI网站中的一个基因表达数据库
GEO包括五种主要的记录
平台记录GPL***
样品记录GSM***
系列记录GSE***
数据集记录GDS***
表达谱Profile平台、样本、数据集、表达谱和基因实例：查看并分析胃癌相关基因表达数据集GDS1210页面Vinmentin在各样本中的表达谱数据库资源概览2001_2010年结直肠癌易感基因的生物信息学分析
85种转化基因的过敏原性生物信息学评价
代谢性心血管病变_生物信息学的应用
帕金森病路易（小）体的蛋白质生物信息学数据分析
蛋白质相互作用网络进化分析研究进展
可变剪接与疾病的生物信息学研究概况
DNA甲基化的生物信息学研究进展
新型长链非编码RNA_lncRNA_的生物信息学研究进展
生物信息技术加速开发旧药新用途
基于生物信息学方法发现潜在药物靶标
生物信息学技术在食物过敏原表位预测中的应用
生物信息学在免疫学上的应用