【源版】SYBYL软件与计算机辅助药物设计.ppt

SYBYL软件与计算机辅助药物设计 凯鹏视算技术有限公司美国Tripos公司是业界非常著名的高科技公司。Tripos的主营业务包括三个方面： 新化合物研发软件产品 软件咨询服务 新化合物的研发与销售世界上最大的15家制药公司都购买了Tripos的软件产品作为重要的研究手段。TriposResearchandServiceUserLists-高等院校UserLists-高等院校中国科学院上海药物研究所
中国科学院上海有机研究所计算机化学开放实验室
中国科学院上海有机研究所国家生物有机及天然产物重点实验室
中国科学院贵州省天然产物化学重点实验室
中国科学院上海生物工程研究中心
中国科学院化工冶金研究所计算机化学开放实验室
中国科学院昆明动物研究所
中国科学院昆明植物研究所
中国科学院武汉物理研究所
中国科学院广州化学研究所
中国科学院长春应用化学研究所
中国科学院上海分院中国医学科学院北京药物所有机合成室
中国医学科学院北京药物所国家药物及代谢产物分析研究中心
中国医学科学院天津血液学研究所
北京药物化学研究所北京微生物流行病研究所
四川抗菌素研究所
上海医药工业研究院
上海转基因研究所
江苏农药研究所
东北制药集团

山东大学药学院
南京大学化学院
天津药物研究院
军事医学科学院
药物研发的进程第一个SBDD方法设计的新药碳酸酐酶抑制剂Dorzolamide(治疗青光眼疾病)于1994年上市
Wellcome公司用CADD方法设计的5－HT1D受体激动剂311C90(治疗偏头痛)，进入三期临床研究
美国EliLilly公司开发的第一个高效、高选择性人体非胰腺分泌型磷脂酶抑制剂LY311727,进入临床研究
4个已上市的HIV-1蛋白酶抑制剂类药物的研制过程中，计算机辅助药物设计起了重要作用
2个凝血酶抑制剂已进入临床研究
Glaxo开发的唾液酸酶抑制剂4-胍基Nen5Ac2en(抗感冒药物)进入临床研究
治疗糖尿病药物(醛糖还原酶抑制剂)上市TriposSoftwareSYBYL®andUNITY®Solutions MolecularModelling&Visualisation分子建模与可视化SYBYLMOLCADAdvancedComputationQSAR&ADME定量构效关系与药动学性质预测QSAR&ADMEQSAR的工作原理Structures+ActivityQSAR-3DQSAR-CoMFACoMFA-InterpretationADME--VolSurfDescriptors-visualisationPharmacophorePerception药效团分析WhatisaPharmacophore?药效团分析模块的应用DISCOtech的工作原理HowdoesGASPwork?ChemicalInformatics化学信息学UnityUnityexample-2DsearchingUnityexample-similaritysearchingBiomolecularSoftware生物大分子显示，修改，优化Composer（同源模建）GeneFold（高级穿线法）FUGUE（远程同源模建）ProTable（合理性分析）VirtualScreening虚拟筛选ΔG=-RTlnKi成功案例FlexX的优点工作原理FlexX–唾液酸酶CScorePPAR-基因转录因子，以配体激活方式调控脂肪细胞分化。
PPARγ激动剂是很有前途的胰岛素增敏剂,2种新药2000年FDA批准在美国上市，其中罗格列酮(GSK)销额$10亿(2000～2001年）。DatabasePPAR(Peroxisomeproliferator-activatedreceptor)PPARDDDC-P-06complexesMolecularDiversity&CombinatorialChemistryLegion/CombiLibMakerSelector-FilteringDescriptorsFingerprints/HologramsDescriptorsCoMFAFieldsSelector-DiversitySelectionDiverseSolutions-DiversitySelectionThanks!