猪TAF7基因的克隆、染色体定位和组织表达谱分析.pdf

中国农业科学2009,42(1):267-273
ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2009.01.034
猪TAF7基因的克隆、染色体定位和组织表达谱分析

张兴举，唐中林，王志伟，杨述林，牟玉莲，崔文涛，马月辉，储明星，李奎

（中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/中国农业科学院家养动物遗传资源与种质创新重点开放实验室，北京100193）

摘要：【目的】通过对猪TAF7基因初步的研究，为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息，为猪的遗传育
种提供分子标记。【方法】以五指山猪为研究对象，克隆TAF7基因，分析该基因结构特点，然后利用IMpRH（the
INRA-UniversityofMinnesotaporcineradiationhybrid，法国农业科学院-明尼苏达大学的辐射杂种克隆板）
分析该基因在猪染色体上定位信息，利用半定量RT-PCR方法，分析该基因在成年五指山猪16个不同组织（心脏、
背肌、淋巴、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、子宫、睾丸、胃、小肠、大肠、卵巢、胸腺、脑、脂肪）的表达谱信息。
【结果】克隆得到长1701bp的五指山猪TAF7基因序列，其中包括1050bp完整CDS（CodingSequence，编
码序列）区域，分析表明其编码含349个氨基酸的蛋白质。利用IMpRH分析结果表明，猪TAF7基因与分子标记
SW1879和IL4（interleukin-4，白细胞介素-4）紧密连锁，LOD（LimitofDetection，检测极限）值分别为6.69
和6.15。组织表达谱分析结果显示该基因在大多数组织中均有表达，其中在睾丸表达量较高，而在心脏、背肌中
表达很低。【结论】猪TAF7基因5’UTR中有一个短的内含子，而在该基因CDS区域没有内含子。猪TAF7蛋白序列
与人TAF7蛋白序列的相似性较高，二者在生物系统发育树中的距离最接近。猪TAF7基因在大多数组织中均表达，
在猪睾丸中表达量较高，证实它调节目的基因转录具有广泛性。
关键词：猪TAF7基因；克隆；基因定位；组织表达谱

Cloning,MappingandTissueExpressionProfileofPorcineTAF7Gene

ZHANGXing-ju,TANGZhong-lin,WANGZhi-wei,YANGShu-lin,MUYu-lian,CUIWen-tao,MAYue-hui,
CHUMing-xing,LIKui

(TheKeyLaboratoryofDomesticAnimalGeneticResourcesandGermplasmInnovationofCAAS,InstituteofAnimalScience,
ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100193)

Abstract:【Objective】TheobjectiveistoilluminatethemolecularfeaturesandtheexpressionprofileoftheporcineTAF7
(TBP-associatedfactor;TBPisaTATA-bindingprotein)gene.Asonecomponentofthetranscriptionalpre-initiationcomplex,the
proteinTAF7playsanimportantroleduringregulationofthegeneexpression.【Method】TheporcineTAF7genefromthe
Wuzhishanpigsamplewasclonedandsequenced,andthenitsmolecularfeatureswereanalyzed.MappingoftheporcineTAF7gene
toporcinechromosomewasmadewiththeIMpRHpanel.ThemRNAdistributionprofileoftheporcineTAF7geneinsixteenadult
Wuzhishanpigtissues(heart,dorsalmuscles,lymphnodes,spleen,liver,kidney,lung,uterus,testicle,stomach,smallandlarge
intestine,ovaries,thymusgland,brainandfat)wereexaminedbysemi-quantitativeRT-PCR.【Result】Asequencewithalengthof
1701bpwascloned,it