预览加载中,请您耐心等待几秒...
1/2
2/2

在线预览结束,喜欢就下载吧,查找使用更方便

如果您无法下载资料,请参考说明:

1、部分资料下载需要金币,请确保您的账户上有足够的金币

2、已购买过的文档,再次下载不重复扣费

3、资料包下载后请先用软件解压,在使用对应软件打开

基于高通量测序技术的玉米不同生育时期土壤细菌多样性变化 摘要: 本研究旨在利用高通量测序技术,研究玉米不同生育时期土壤细菌多样性的变化。通过对不同生育时期的玉米样本进行测序,获取土壤细菌的16SrRNA序列,并利用生物信息学分析方法,对土壤细菌的多样性进行评估和比较。结果表明,玉米的生育时期对土壤细菌的组成和丰度有显著影响。这些结果有助于我们进一步了解玉米的生长过程中,土壤微生物的作用和功能。 1.引言 玉米作为重要的经济作物之一,其生长过程中土壤细菌对其生长发育起着重要的作用。传统的细菌分离和鉴定方法存在着工作量大、耗时长以及只能鉴定少部分菌种等问题。而高通量测序技术的出现,能够快速准确地获取土壤微生物群落的信息,提高我们对土壤微生物多样性的认识。 2.实验方法 本研究采集玉米不同生育时期的土壤样本,并进行样本处理和DNA提取。利用通用的16SrRNA引物对土壤样本中的16SrRNA基因进行PCR扩增,然后进行高通量测序。得到测序数据后,利用生物信息学分析软件对数据进行质控和过滤,得到高质量的序列。然后利用各种指标对土壤细菌多样性进行评估和分析。 3.结果与讨论 通过对测序数据的分析,我们得到了玉米不同生育时期土壤细菌的组成和丰度信息。结果表明,不同生育时期的土壤细菌组成存在差异。在播种期,土壤细菌的丰度较低,主要以芽孢杆菌属为主。而在拔节期和抽穗期,土壤细菌的丰度明显增加,类芽孢杆菌属以及一些可降解植物残渣的细菌属(如纤维素分解菌属等)明显增加。这些结果说明,土壤细菌在玉米生长过程中起着重要的作用,特别是在生长后期有助于玉米植株的生长和发育。 4.结论 本研究通过高通量测序技术,研究了玉米不同生育时期土壤细菌的多样性变化。结果表明,玉米的生育时期对土壤细菌的组成和丰度有显著影响。这些结果对于我们进一步了解土壤微生物对玉米生长发育的调控机制具有重要意义,为优化土壤管理和提高玉米产量提供了理论依据。 5.参考文献 [1]WangY,WangC,TianC,etal.EffectsofthestrawreturningapproachesonsoilbacterialcommunitystructuresandfunctionsinablacksoilofnortheastChina.AppliedSoilEcology,2016,103:100-108. [2]ZhangJ,LiuY,XueC,etal.Linkagesbetweenthesoilmicrobialcommunitystructureandtheabundanceandcompositionofantibioticsresistancegenes.AppliedandEnvironmentalMicrobiology,2017,83(23):e01464-17. [3]CaporasoJG,LauberCL,WaltersWA,etal.Globalpatternsof16SrRNAdiversityatadepthofmillionsofsequencespersample.PNAS,2011,108(Suppl1):4516-4522. [4]EdgarRC.UPARSE:highlyaccurateOTUsequencesfrommicrobialampliconreads.NatureMethods,2013,10(10):996-998. [5]ShannonCE.Amathematicaltheoryofcommunication.BellSystemTechnicalJournal,1948,27:379-423,623-656.