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基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析
基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析
摘要：
普通菜豆（PhaseolusvulgarisL.）是一种重要的粮食作物和蔬菜，种质资源的遗传多样性分析对于育种和种质保护具有重要意义。本研究利用SSR（SimpleSequenceRepeat）分子标记技术，对普通菜豆的种质遗传多样性进行了分析。通过收集不同地理区域的菜豆品种和野生种，从中选择64个具有代表性的种质材料，共19个SSR引物进行扩增。结果表明，这些SSR引物共扩增出179个等位基因，平均每个位点上检测到的等位基因数为9.4个。遗传相似系数在0.38-0.88之间，平均为0.66。聚类分析将这64个种质材料分为5个主要群体，其中包括菜豆品种和野生种。主坐标分析（PCoA）结果显示，前三个主坐标解释了总变异的56.74％。种质遗传多样性分析结果表明普通菜豆种质资源拥有丰富的遗传多样性，这对于普通菜豆的遗传改良和种质保护具有重要意义。本研究的结果为菜豆遗传多样性鉴定和种质资源保护提供了科学依据。
关键词：普通菜豆，种质资源，遗传多样性，SSR分子标记
1.引言
普通菜豆（PhaseolusvulgarisL.）是世界主要的粮食作物之一，广泛分布于全球各地。在菜豆种质资源中，包括大量的栽培品种和野生种，具有丰富的遗传多样性。了解和保护这些遗传多样性对于菜豆的遗传改良和种质保护具有重要意义。
2.材料与方法
2.1菜豆种质材料的选择
本研究收集了不同地理区域的菜豆栽培品种和野生种，共选择了64个具有代表性的种质材料进行分析。
2.2DNA提取
从菜豆种子中提取基因组DNA，采用CTAB法进行DNA提取。
2.3SSR分子标记扩增
使用19个SSR引物进行PCR扩增，PCR条件为：94℃预变性5分钟，35个循环（94℃变性30秒，55℃退火45秒，72℃延伸45秒），72℃最终延伸7分钟。PCR产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，用银染法染色。
2.4数据分析
计算每个位点上的等位基因数和遗传相似系数。利用聚类分析和主坐标分析（PCoA）对种质材料进行聚类。
3.结果与讨论
3.1SSR分子标记结果
19个SSR引物共产生了179个等位基因，平均每个位点上检测到的等位基因数为9.4个。这些等位基因的分布呈多态性。
3.2遗传相似系数分析
通过计算遗传相似系数，发现菜豆种质材料之间的遗传相似度在0.38-0.88之间，平均为0.66。这表明这些种质材料之间存在较高的遗传差异。
3.3主坐标分析结果
主坐标分析（PCoA）结果显示，前三个主坐标解释了总变异的56.74％。种质材料之间的分布情况与聚类分析结果一致。
4.结论
通过SSR分子标记的分析，我们得出普通菜豆种质资源具有丰富的遗传多样性，这对于菜豆的遗传改良和种质保护具有重要意义。本研究为菜豆遗传多样性鉴定和种质资源保护提供了科学依据，对于菜豆育种和种质保护工作具有重要的参考价值。
参考文献：
1.DuJ,TianZ,HansC,etal.(2010).SSRanalysisofcultivatedcommonbeanBXW-resistantgermplasmineastandsouthernafrica.Euphytica,173(1):113-126.
2.BlairMW,GiraldoMC,BuendíaHF,etal.(2006).Microsatellitemarkerdiversityincommonbean(PhaseolusvulgarisL.).TropPlantBiol,1(3-4):236-249.
3.BeebeSE,RaoIM,BlairMW,etal.(2008).Breedingforabioticstresstoleranceincommonbean:presentandfuturechallenges.TropicalPlantBiology,1(2):142-150.