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基于EST-SSR标记的茅苍术种质资源遗传多样性分析
基于EST-SSR标记的茅苍术种质资源遗传多样性分析
摘要：
茅苍术（AtractylodesmacrocephalaKoidz.）是一种重要的药用植物，具有广泛的药用价值。然而，茅苍术的种质资源遗传多样性研究相对较少，限制了其育种和遗传改良工作的开展。本研究采用EST-SSR标记分析了茅苍术种质资源的遗传多样性，旨在为茅苍术的种质资源保护和育种提供科学依据。结果显示，茅苍术种质资源存在较高的遗传多样性，为解析茅苍术的遗传基础和开发利用种质资源提供了重要的参考。
关键词：茅苍术；种质资源；遗传多样性；EST-SSR标记
引言：
茅苍术是茅蓬属植物，是一种重要的中药材之一。其根茎富含挥发油和多种药用成分，具有平肝、散寒、利湿、止呕等功效。茅苍术广泛应用于中医药领域，被誉为“北方人参”。然而，茅苍术地理分布有限，资源相对稀缺，多年来受到采挖过度和林地开发等因素的影响，种群数量逐渐减少，濒临灭绝。因此，保护和合理利用茅苍术种质资源是当务之急。
种质资源的遗传多样性是衡量物种适应性和生存能力的重要指标。通过研究茅苍术种质资源的遗传多样性，可以深入了解其遗传背景、亲缘关系以及适应环境的能力，为茅苍术的种质资源保护和育种提供科学依据。鉴于EST-SSR标记具有多态性高、重复性好、分辨率高等特点，本研究选择EST-SSR标记对茅苍术种质资源进行遗传多样性分析。
材料与方法：
本研究收集茅苍术种质资源样本30份，分布于不同地理区域。提取样本总DNA并进行质检，选择合格样本进行EST-SSR标记扩增。使用已标记的EST-SSR引物进行PCR扩增，并采用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳分析得到位点结果。根据扩增片段的大小，计算各位点的等位基因数目、观测杂合度、群体遗传多样性等遗传参数。应用适当的统计方法，计算样本间的遗传距离，并进行系统聚类分析和主成分分析。
结果与讨论：
本研究共筛选出20对EST-SSR引物，在茅苍术种质资源样本中检测到254个等位基因。平均等位基因数目为12.7个，观测杂合度为0.63，群体遗传多样性为0.76。遗传距离分析结果显示，不同地理区域的茅苍术种质资源之间存在较大的遗传差异，但同一地理区域的茅苍术种质资源之间的遗传距离相对较小。主成分分析结果显示，前三个主成分解释了总方差的72.5%，表明遗传多样性主要来源于地理区域的差异。
结论：
本研究利用EST-SSR标记对茅苍术种质资源进行了遗传多样性分析，结果表明茅苍术种质资源存在较高的遗传多样性。不同地理区域的茅苍术种质资源之间存在遗传差异，但同一地理区域的茅苍术种质资源之间的遗传距离相对较小。这为茅苍术的遗传改良和种质资源保护提供了重要的参考。同时，本研究还对茅苍术种质资源的群体遗传结构和亲缘关系进行了初步分析，为茅苍术的育种工作提供了基础信息。
参考文献：
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