动物基因组学ppt课件.ppt

动物基因组学
（AnimalGenomics）主要内容第一节
人类基因组计划
（HumanGenomeProject）人类基因组计划（1）人类基因组计划（2）
序列测定方法2人类基因组计划的意义基因组大小的比较（1）基因组大小的比较（2）
基因组（Genome）就是指生物体染色体、细胞器中所含的全套遗传物质；一种生物全部基因的集合称为“基因组”。

基因组学（Genomics）就是研究基因组结构和功能的科学。

基因组学的分类
第二节
比较基因组与功能基因组
（ComparativeGenome&FunctionalGenome）遗传图谱：又称连锁图谱(linkagemap)，它是以具有遗传多态性（在一个遗传位点上具有一个以上的等位基因，在群体中的出现频率皆高于1%）的遗传标记为“路标”，以遗传学距离（在减数分裂事件中两个位点之间进行交换、重组的百分率，1%的重组率称为1cM）为图距的基因组图。

物理图谱：物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传信息及其在每条染色体上的相对位置线性而系统地排列出来。16
什么是比较基因组学？19*蛋白组（Proteome）
蛋白质组是指“一种基因组所表达的全套蛋白质”。
*蛋白组学（Proteomics）
一门在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科。
*蛋白组学与功能基因组学息息相关。1.蛋白质分离和鉴定：2.翻译后修饰：翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定：如分析酶活性和确定酶底物，细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。4.对人类而言，蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康，主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质，而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。生物芯片1生物芯片2第三节
生物信息学
（Bioinformatics）背景知识生物信息学是以生物大分子为研究对象，以计算机为工具，运用数学和信息科学的观点、理论和方法去研究生命现象、组织和分析呈指数级增长的生物信息数据的一门科学.主要研究内容13、功能基因组相关信息分析
包括与大规模基因表达谱分析相关的算法、软件研究，基因表达调控网络的研究；与基因组信息相关的核酸、蛋白质空间结构的预测和模拟，以及蛋白质功能预测的研究。
4、生物大分子结构模拟和药物设计
包括RNA(核糖核酸)的结构模拟和反义RNA的分子设计；蛋白质空间结构模拟和分子设计；具有不同功能域的复合蛋白质以及连接肽的设计；生物活性分子的电子结构计算和设计；纳米生物材料的模拟与设计；基于酶和功能蛋白质结构、细胞表面受体结构的药物设计；基于DNA结构的药物设计等。5、生物信息分析的技术与方法研究
包括发展软件、数据库工具；改进现有的理论分析方法；创建一切适用于基因组信息分析的新方法、新技术。包括引入复杂系统分析技术、信息系统分析技术等；建立严格的多序列比较方法；发展与应用密码学方法以及其他算法和分析技术；发展研究基因组完整信息结构和信息网络的研究方法等；发展生物大分子空间结构模拟、电子结构模拟和药物设计的新方法与新技术。
6、应用与发展研究
汇集与疾病相关的人类基因信息，发展患者样品序列信息检测技术和基于序列信息选择表达载体、引物的技术，建立与动植物良种繁育相关的数据库以及与大分子设计和药物设计相关的数据库。EMBL、GenBank和DDBJ是国际上三大主要核酸序列数据库。

EMBL是由EuropeanMolecularBiology
Laboratory于1982年创建的，目前由欧洲生物信息学研究所负责管理。数据库网址是：http://www.ebi.ac.uk/embl/。美国国家健康研究院NIH也于80年代初委托洛斯阿拉莫斯国家实验室建立GenBank，后移交给国家生物技术信息中心NCBI，隶属于NIH下设的国家医学图书馆。NCBI的网址是：http://www.ncbi.nlm.nih.gov。32DDBJ是DNADataBaseofJapan的简称，创建于1986年，由日本国家遗传学研究所负责管理。DDBJ的网址是：http://www.ddbj.nig.ac.jp/。

1988年，EMBL、GenBank与DDBJ共同成立了国际核酸序列联合数据库中心，建立了合作关系。蛋白质数据库13.PROSITE
PROSITE数据库收集了生物学有显著意义的蛋白质位点和序列模式，并能根据这些