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鲤基因组作图及生长相关基因定位研究
随着基因组技术的发展，构建物种的基因组已经成为现代生物学的重要课题。在这方面，鲤鱼基因组的作图和生长相关基因的定位研究已经引起了广泛的关注。本文将介绍鲤鱼基因组的作图过程以及生长相关基因的定位研究。
一、鲤鱼基因组的作图
1.1鲤鱼基因组的序列分析
鲤鱼（Cyprinuscarpio）是家庭鱼类中的重要物种之一，是食品资源和经济贸易的重要对象。为了深入研究鲤鱼生物学特性和生长规律，在2014年，鲤鱼的全基因组序列首次被解读出来。该研究由中国科学院动物研究所和浙江大学共同完成，采用IlluminaHiSeq平台高通量测序技术，利用WGS和统计遗传学方法组合分析得到了鲤鱼基因组的参考序列。
1.2鲤鱼基因组的构建和物理图谱
在基因组测序的基础上，鲤鱼基因组的物理图谱也被成功地构建出来。该研究使用RadiationHybrid(RH)技术，构建了7118个物理图谱位置，并将物理图谱与基因组基于连锁分析结果进行结合，建立了1,061,070个SNP位点的高密度遗传图谱。
1.3鲤鱼基因组的作图和注释
对于基因组物理图谱和序列数据整合，研究人员可以使用遗传图和物理地图辅助和限制开展基因组注释。在鲤鱼基因组的注释过程中，研究人员采用了多种方法，包括基于相似性的注释、基于经验的注释和基于RNA测序的注释。结果显示，该研究对鲤鱼基因组进行了全面的注释，包括3024个ncRNA和7619个蛋白质编码基因。
二、生长相关基因的定位研究
随着鲤鱼基因组的解读和作图，许多生长相关基因家族的研究也引起了关注。在此研究中，研究者鉴定了一组与体型生长和大小的调控相关的候选基因，并在鲤鱼遗传图谱上进行了精确定位。
2.1EST-SSR标记的选择
在生长相关基因定位研究中，研究者采用了基于EST-SSR标记的策略。EST-SSR标记具有以下优点：简单易施，具有高度多态性，便于开展高通量单倍型分析，以及在较短的时间内实现筛选候选标记的目标。
2.2候选基因的鉴定
在该研究中，研究者鉴定了8个与体型生长和大小的调控相关的基因家族，这些基因家族包括発育素、生长激素、生长相关基因（GRF）和核转录因子。通过对这些基因家族的系统研究，研究者得出了许多与生长相关的基因并开展了相关分析。
2.3基因定位
将候选标记与遗传图谱上的多态位点连锁分析，鉴定出与生长相关的基因定位在遗传图谱上的位置。结果显示，有5个候选标记被定位在鲤鱼遗传图谱上，这些标记对应的基因包括了发育素和GRF家族。
三、结论
通过鲤鱼基因组的作图和生长相关基因的定位研究，我们可以发现鲤鱼基因组结构和组成的相关特性，并且也为生长调控这一方面的研究提供了更加深入和精准的工具。未来，这种技术将进一步发展，为我们深入了解这样的物种以及组织生长调控提供更大的帮助和指导。