遗传信息传递的整体性专家讲座.pptx

第十九章
第一节

基因组学
Genomics一、基因组就是一个生物拥有全部遗传信息总合二、基因组学包含结构基因组学、功效基因组学和比较基因组学三、结构基因组学主要任务是基因组作图和大规模测序1986，Dulbecco，提出人类基因组计划；
1990，国际人类基因组计划开启；
1998，CeleraGenomics成立，挑战国际人类基因组
测序组织；
1999年9月，中国加入该计划；
1999年12月，第22号染色体破译；
年6月26日，各国科学家公布人类基因组工作框
架图；
年4月14日，国际人类基因组测序组织宣告人类
基因组序列图绘制成功。togeneratephysical,genetic,andsequencemapsofthehumangenome;
tosequencethegenomesofavarietyofmodelorganisms;
todevelopimprovedtechnologiesformappingandsequencing;
todevelopcomputationaltoolsforcapturing,storing,analyzing,displaying,anddistributingmapandsequenceinformation;
tosequenceESTfragmentsofcDNAs(expressedsequencetags,orESTs,aresingle-sequenceruns[600bp]onthecDNAinserts)andeventuallyfull-lengthcDNAsencodingtheexpressedmRNAsindifferentcelltypesofhumansandmice;
toconsidertheethical,social,andlegalchallengesposedbygenomicinformation.1．遗传作图

2．物理作图遗传作图（geneticmapping）:就是确定连锁遗传标志位点在一条染色体上排列次序及它们之间相对遗传距离，用厘摩尔根（centi-Morgan，cM）表示，当两个遗传标识之间重组值为1%时，图距即为1cM。*DNA标识①限制性片段长度多态性（RFLP）：
利用特定限制性内切酶识别并切割基因组DNA，得到大小不等DNA片段，所产生DNA数目和各个片段长度反应了DNA分子上不一样酶切位点分布情况。②可变数目串联重复序列（VNTR）：
又称微卫星DNA（minisatelliteDNA），是一个重复DNA短序列。VNTR基本原理与RFLP大致相同，经过限制性内切酶酶切和DNA探针杂交，可一次性检测到众多微卫星位点，得到个体特异性DNA指纹图谱。③单核苷酸多态性（SNP）：
SNP不以“长度”差异作为检测伎俩，而是直接以序列变异作为标识。SNP是指在基因组水平上由单个核苷酸变异所造成DNA序列多态性。SNP是人类可遗传变异中最常见一个，也是基因组中最为稳定变异。SNP最大程度地代表了不一样个体之间遗传差异，因而成为研究多基因疾病、药品遗传学及人类进化主要遗传标识。遗传信息传递的整体性物理作图（physicalmapping）是在遗传作图基础上制作更详细人类基因组图谱。包含：

荧光原位杂交图（FISHmap）
限制性酶切图（restrictionmap）
连续克隆系图（clonecontigmap）①荧光原位杂交图（fluorescentinsituhybridizationmap，FISHmap）：将荧光标识探针与染色体杂交确定分子标识所在位置。

②限制性酶切图（restrictionmap）：将限制性酶切位点标定在DNA分子相对位置。③连续克隆系图（clonecontigmap）：采取酶切位点稀有限制性内切酶或高频超声破碎技术将DNA分解成大片段后，再经过构建酵母人工染色体（yeastartificialchromosome，YAC）或细菌人工染色体（bacterialartificialchromosome，BAC）获取含已知基因组序列标签位点（sequencetaggedsite，STS）DNA大片段。*STS（sequencetaggedsite，基因组序列标签位点）：是指染色体定位明确，而且可用PCR扩增单拷贝序列，每隔100kb距离就有一个标志。在STS基础上构建能够覆盖每条染色体大片段DNA连续克隆系就可绘制精细物理图谱，为大规模DNA测序做好了准备。（二）经过BAC克隆系、鸟枪法等完成大规模DNA测序2．鸟枪法是大规模DNA测序主要方法鸟枪法DNA测序主要步骤：3．高通量测序技术大大加紧了基因组DNA测序进行（三）生物信息学是预测基因组结构和功效主要伎俩四、功效基因组学系统探讨基因