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基因组概论第一节基因组的功能单位——基因基因的特点和鉴别方法1.开放阅读框(openreadingframe,ORF) *始于起始密码子并终于终止密码子的一串密码子。 *从mRNA中找出大的ORF来确定编码蛋白质的基因; *适合于从DNA序列中鉴别原核生物基因和含少量内含子的真核基因。 *但对于一些短少的基因及一些内含子丰富的基因则很难鉴别。2.序列特征——密码子偏爱和剪接点3.序列保守性除以上鉴定基因的五项标准之外,在实施过程中还有些麻烦的问题,如重叠基因、变通性断裂基因、假基因等。第二节基因组1.基因组大小与C值佯谬GenomicContentsforComparison2.基因总数与N值佯谬既然一切生物性状都是由基因决定的,那么生物体的DNA含量(C值)和质量(N值)就应该与生物进化阶梯及复杂性成正相关。 生物体结构与功能的复杂程度不仅取决于一定的基因数量,更重要的是在于基因功能及其相互作用网络的复杂性和精确性。 第三节基因组计划 (genomeproject)HGP主要任务及内容其他基因组计划第四节基因组学后基因组计划基因组学的延伸——模式生物基因组学 五大模式生物:E.coli、酿酒酵母、黑腹果蝇、秀丽线虫和小鼠,其序列分析被列为HGP的内容; 不同物种间功能基因有相当大保守性,如99%鼠基因与人对应; 最终目的:比较基因组学——比较不同物种的全基因组,增强对各基因功能的认识。 从分子水平上升到细胞水平——细胞计划 在阐明以基因为核心的生命物质的本质后,以信号传导为主线阐明在细胞内一切生命现象的本质。 1950年代生物学从细胞水平深入到分子水平是一次飞跃,但现在似乎又正返回到细胞水平! 新型学科与产业的发展——生物信息学和生物芯片基因组与蛋白质组知识库