团头鲂EST-SSR的开发及在育种中的应用.docx

团头鲂EST-SSR的开发及在育种中的应用
随着生物技术的不断发展，特别是在分子生物学领域的快速发展，分子标记技术在育种中得到了广泛的应用。其中EST-SSR（Expressedsequencetag-simplesequencerepeat）是一种新兴的分子标记技术，可以帮助育种者加快育种过程，并最终提高农业生产效益。本文以团头鲂为研究对象，将团头鲂EST-SSR的开发及在育种中的应用作为研究主题，通过文献综述和分析，旨在提供一些对团头鲂EST-SSR技术开发和育种应用的初步了解。
一、团头鲂
团头鲂属于鲻形目、鲤科，是我国南方淡水鱼（见图1）。它是一种常见的鱼类，分布范围较广，广泛分布于长江流域和珠江流域等。该鱼肉质鲜美，适口性佳，且蛋白质含量较高，能够满足人们日常生活的需要，并有较高的经济价值。
图1.团头鲂
二、EST-SSR技术的开发
1.EST技术
EST是全称为“简化转录组标记”的英文缩写，即ExpreSsedSequenceTag，是从cDNA文库中随机抽取单链DNA序列，并经过测序分析，得到约200-600个碱基长的转录本标签序列。由于EST是来自于某些组织、某个阶段的转录本序列，它涵盖了许多重要基因在转录时的信息，具有很高的表观谱特异性。
2.SSR技术
SSR是全称为“简单序列反复”的英文缩写，即SimpleSequenceRepeat，指序列中重复出现的短片段，通常由长度在1-6个碱基的核苷酸（如ACACAC、ATTATTATT等）组成。SSR是遗传多态性较高的分子标记，具有遗传变异大、稳定性好、可扩增性强、技术简便、重复性好等优点，因此被广泛应用于种质资源鉴定、亲缘关系分析、遗传图谱绘制和QTL定位等方面。
在团头鲂的EST序列中，含有的SSR位点非常丰富，高达11.5%，其中以单二核苷酸重复序列为主。因此，团头鲂的EST-SSR技术开发具有较为丰富的资源基础，可以为其molecularbreeding提供良好的分子标记工具。
三、团头鲂EST-SSR技术在育种中的应用
1.遗传多样性分析
团头鲂具有良好的经济性状，但遗传多样性较低，特别是在不同养殖区域之间的差异较小。因此，为了提高团头鲂的遗传多样性并保护其遗传资源，研究人员可以运用EST-SSR技术获取不同样本之间的遗传信息，进行亲缘关系分析和遗传多样性评估。这些信息可以为育种者提供合适的材料，从而达到提高生产效益和保护遗传资源的目的。
2.分子标记辅助选育
传统育种方法往往需要长时间的筛选和繁殖过程，周期长、成本高，效率低下。运用EST-SSR技术可以加速育种过程，辅助选取优良品系，达到提高生产效益和提高抗逆性的目的。包括选择高产、高营养价值、抗病性强的个体，繁殖并选育最终成熟的品种。与传统育种相比，分子标记辅助选育可以减少选及品系的流程、缩短选育周期，从而降低成本和时间成本。
3.基因组及QTL分析
基因组是组成生物体的基础，其高清的序列信息可以为探索生物形态、生理和功能关系提供必要的材料。EST-SSR技术可以获取育种对象基因组序列重要部分的信息，为基因组设计和进一步功能评价提供基础数据。另外，运用EST-SSRs还可以进行QTL分析，研究某种性状的遗传定位位置，并对其进行基因克隆和功能研究。
综上所述，团头鲂EST-SSR技术是一种有效的分子标记方法，能够为团头鲂遗传资源的保护、多样性分析和分子育种提供便捷、高效的工具。将来，我们可以进一步挖掘EST-SSRs技术的潜力，同时探索更多其他功能，以提高育种的效率和效益。