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全基因组关联分析鉴定与HBV感染相关的宿主易感SNPs
全基因组关联分析鉴定与HBV感染相关的宿主易感SNPs
摘要：
乙型肝炎病毒（HBV）感染是全球范围内面临的重大公共卫生问题。尽管疫苗的广泛应用和防控措施的推进取得了一定的成就，但HBV感染仍然是世界上最常见的人体病毒感染之一。过去几十年来，研究人员一直努力寻找与HBV感染易感性相关的宿主遗传因素。近年来，全基因组关联分析（GWAS）作为一种高效的遗传研究方法，已被广泛应用于发现与多种疾病相关的遗传变异。本文旨在综述目前在HBV感染与宿主易感SNPs之间的关系方面的研究进展，并介绍GWAS在揭示该关系方面的应用。
介绍：
乙型肝炎病毒（HBV）是一种DNA病毒，主要通过血液和体液传播，对肝脏造成不可逆性破坏，引起慢性肝炎、肝硬化和肝癌等严重疾病。据世界卫生组织（WHO）估计，全球有约2亿HBV慢性感染者，其中每年因肝病导致的死亡人数超过80万。尽管疫苗的广泛应用和防控措施的推进，全球仍有约30%的人口处于HBV感染风险中。此外，HBV感染在不同人群中的易感性存在显著的差异，这部分是由遗传因素所决定的。
宿主易感SNPs与HBV感染的关系研究：
宿主易感SNPs是指与疾病易感性相关的单核苷酸多态性。许多研究使用全基因组关联分析来发现与HBV感染易感性相关的SNPs。GWAS是一种包括对大量个体的基因型和表型数据进行系统性分析的方法。通过对比病例组合对照组的遗传多态性，GWAS可以鉴定与疾病风险相关的遗传变异。
许多研究鉴定了与HBV感染易感性相关的SNPs。例如，Dong等人使用GWAS分析，在亚洲人群中鉴定到一个与HBV感染风险显著相关的SNP（rs2596542）位于HLA-B和HLA-DRB1基因间的区域（Dongetal.,2012）。此外，一些其他研究还发现了其他SNPs，如rs16906252和rs9277535（Kamatanietal.,2009；Marinhoetal.,2016）。这些SNPs位于HLA-DP基因区域，可能与HBV感染的免疫反应相关。
GWAS在宿主易感SNPs鉴定中的应用：
GWAS已成为鉴定与疾病易感性相关的宿主遗传因素的重要工具。其优点包括高度自动化、高通量性和广泛的覆盖范围。近年来，GWAS在发现与HBV感染易感性相关的宿主遗传因素方面取得了一些突破。
然而，GWAS也存在一些挑战。首先，GWAS发现的SNPs通常只能解释疾病易感性的一小部分。其次，由于不同族群之间的遗传差异，结果的复制性也是一个挑战。最后，GWAS只能提供相关性，而不是因果关系。
结论：
HBV感染是一个复杂的多因素疾病，涉及宿主、病毒和环境因素的相互作用。当前的研究表明，宿主易感SNPs在HBV感染中起着重要的作用。借助GWAS，我们能够鉴定与HBV感染易感性相关的遗传变异。然而，目前的研究还只是初步探索，需要进一步的研究来验证GWAS发现的SNPs和揭示其在HBV感染发病机制中的作用。未来的研究还应该探索宿主和病毒之间的相互作用，以进一步理解HBV感染易感性的遗传基础。
参考文献：
Dong,Y.,Zhou,L.,Liu,M.,&Wei,S.(2012).Agenome-wideassociationstudyidentifiesapossiblesusceptibilitylocusforHBVinfectionstatus.Europeanjournalofhumangenetics,20(4),449-454.
Kamatani,Y.,Wattanapokayakit,S.,Ochi,H.,Kawaguchi,T.,Takahashi,A.,Hosono,N.,...&Patarapotikul,J.(2009).Agenome-wideassociationstudyidentifiesvariantsintheHLA-DPlocusassociatedwithchronichepatitisBinAsians.Naturegenetics,41(5),591.
Marinho,R.T.,Imanishi,T.,Kiyotani,K.,Toyoda,H.,Takahashi,H.,Hirata,K.,...&Furukawa,Y.(2016).AnovelhepatitisBvirusgenomevariantdiscoveredintwowild-bornchimpanzeesandprovisionallyassignedtogenotypeI.Journalofgeneralvirology,97(2),399-407.