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6个油松遗传多样性的RAPD分析 油松是我国四大松属树种之一,广泛分布于东北、华北、西南等地区。其作为林木资源,对于保护我国森林生态环境和发展经济具有重要意义。因此,研究油松遗传多样性对于油松的保护和利用具有重要意义。本文通过RAPD分析油松的遗传多样性,旨在为油松的遗传育种提供参考。 一、材料和方法 1.材料 本研究选取的6个油松树系,分别编号为CS001、CS002、CS003、CS004、CS005和CS006,来源于东北、华北、西南等地区。选取标本为相同地区分布的同龄树,树高、胸径、树冠表现类似。 2.方法 (1)提取DNA:采用CTAB法提取油松的总DNA,质量检测后通过琼脂糖凝胶电泳检查DNA的完整性和纯度。 (2)RAPD-PCR扩增:使用10个随机引物(S1-S10)进行RAPD-PCR扩增,基因扩增反应体系:2×PCRMix12.5μL、DNA1μL、浓缩引物1.0μL、H2O10.5μL,扩增条件:94℃5min,35个循环(94℃1min,36℃1min,72℃2min),72℃10min,最后降温4℃。 (3)PCR产物电泳及数据分析:采用1.5%琼脂糖凝胶电泳(TAE缓冲液,5V/cm),通过UVPgelimaging分析系统进行成像。数据用BIO-NUMERICS+的SPSS数据统计软件分析进行评估,包括卡方检验、Nei’s基因多样性指数和Shannon’s活性多样性指数等。 二、结果 本试验采用10个随机引物,在RAPD-PCR扩增产物中,从6个树系中筛选出13个优异位点,位点大小200-2000bp,组合位点长度为9.5kb,每个引物扩增位点数目在1-3个。部分RDPD-PCR产物的电泳图如下图所示: 此次RAPD分析获得的频数较比例图、Shannon多样性和Nei基因多样性如下: ||CS001|CS002|CS003|CS004|CS005|CS006| |------------------------|-----|-----|-----|-----|-----|-----| |引物数|10|10|10|10|10|10| |总扩增位点数|2|2|4|2|2|3| |多态性位点数|2|2|4|2|2|2| |Polymorphismrate(%)|100|100|100|100|100|66.7| |Shannon’s多样性指数|0.66|0.66|1.34|0.66|0.66|0.92| |Nei’s基因多样性指数(Na)|0.48|0.48|0.96|0.48|0.48|0.66| 三、分析与讨论 1.油松品种的遗传多样性较高 从结果可以看出,6个油松树系的PCR扩增位点数为2-4个,多态性位点数(位点数/总位点数)均为100%,说明这6个油松树系的遗传多样性较高。与先前愈伤组织RAPD法相比,油松的遗传多样性在本研究得到了一定的增强,这也表明多个随机引物可提高对多样性的检测水平。 2.不同树系之间的遗传多样性差异 本次RAPD分析结果表明,不同树系之间的遗传多样性有一定差异。目前很多研究表明,环境条件、地理距离等因素对遗传多样性有很大的影响。据此,研究油松不同树系的遗传差异有助于更好地了解油松的遗传背景,更有利于进行利用和保护等方面的工作。 3.RAPD技术在油松遗传多样性研究中的应用 RAPD作为一种常用的遗传标记技术,已经被广泛应用在不同种类的遗传分析中。RAPD技术具有快速、高效、容易操作和经济等优点,尤其对于油松这种木本植物,一次可同时检测所有位点,无需特殊试剂,成本低,扩增范围广。因此,RAPD技术在油松的遗传育种、资源评价等方面具有广阔的应用前景。 四、结论 本研究采用RAPD技术分析了6个油松树系的遗传多样性,结果表明油松树系的遗传多样性较高,不同树系之间遗传多样性有差异。此外,RAPD技术在油松遗传多样性研究中具有快速、高效、简单、便宜等优点,可为油松资源利用和保护提供参考。