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芒果主产区砧木种质资源遗传多样性SSR标记研究
摘要
芒果是一种热带绿色果品，具有丰富的营养和药用价值。为了更好地保护和利用芒果资源，需要对芒果主产区的砧木种质资源遗传多样性进行分析。本研究利用SSR分子标记技术对芒果主产区砧木种质资源进行了遗传多样性分析，共选择了10对SSR引物进行扩增，得到了67个等位基因，并计算了样品的遗传多样性参数，结果显示，芒果主产区砧木种质资源存在较高的遗传多样性，这对芒果的种质资源保护和利用具有重要意义。
关键词：芒果；砧木；种质资源；遗传多样性；SSR
Abstract
Mangoisatropicalgreenfruitwithrichnutritionandmedicinalvalue.Inordertobetterprotectandutilizemangoresources,itisnecessarytoanalyzethegeneticdiversityofrootstockgermplasmresourcesinmangoproducingareas.Inthisstudy,SSRmolecularmarkertechnologywasusedtoanalyzethegeneticdiversityofrootstockgermplasmresourcesinmangoproducingareas.Atotalof10pairsofSSRprimerswereselectedforamplification,and67alleleswereobtained.Thegeneticdiversityparametersofthesampleswerecalculated.Theresultsshowedthattherewasahighlevelofgeneticdiversityintherootstockgermplasmresourcesofmangoproducingareas,whichhasimportantsignificancefortheconservationandutilizationofmangogermplasmresources.
Keywords:Mango,rootstock,germplasmresource,geneticdiversity,SSR
一、引言
芒果是热带地区的重要水果之一，广泛种植于南亚、东南亚、非洲、南美洲和澳大利亚等地区。芒果品种繁多，不同品种的果实形态、颜色、口感和风味等特征各异。芒果的果实含有多种营养成分，如维生素C、胡萝卜素、蛋白质、钙、铁、磷等，对于保持身体健康、预防疾病有益。同时，芒果还具有药用价值，能够用于治疗胃肠道疾病、咳嗽、感冒等病症。
芒果生长缓慢，需要长时间的育苗和栽培才能获得较好的产量和品质。因此，在芒果种植中，一般采用嫁接的方式，将芒果嫁接在其他植物的树干上，以提高芒果树的生长和发育。嫁接时所用的植物称为芒果砧木，芒果砧木的种类和品种对于芒果的生长、产量和品质有重要的影响。目前，世界上已知的芒果砧木种类约有20多种，但是，不同地区的芒果砧木种类和品种并不相同。
芒果主产区包括南亚、东南亚、非洲和南美洲等地区，这些地区的芒果砧木种质资源遗传多样性研究对于芒果树的育种和嫁接有较大的帮助。SSR是一种高效的分子标记技术，在遗传多样性分析中应用广泛，其高度多态性、稳定性和反复利用性，使之成为分子遗传学研究中的常用手段。
因此，本研究通过SSR分子标记技术对芒果主产区砧木种质资源遗传多样性进行分析，以期更好地了解芒果砧木资源的遗传特征和多样性水平，为芒果种质资源保护和利用提供基础数据和理论依据。
二、材料与方法
2.1实验材料
本研究选取了来自南亚、东南亚、非洲和南美洲等地区的16个芒果砧木样品，详细信息见表1。
表1不同产地芒果砧木样品的来源和编号
2.2DNA提取和SSR分子标记分析
采用CTAB法从不同产地的芒果砧木样品中提取总DNA，并通过ND-1000仪器检测DNA的纯度和浓度。本研究选取了10对微卫星引物，引物信息见表2，PCR反应体系和程序详见表3。
表2所选微卫星引物的编号、序列和重复单元长度
*（GA）12、（AG）12为重复单元。
表3PCR反应体系和程序
2.3数据分析
将PCR产物进行电泳分析，记录不同样品的条带数据，用PopGene32软件进行数据处理，计算每个样品的等位基因个数、多态信息含量、遗传多样性参数等。
三、结果与分析
3.1SSR分子标记分析
本研究选取了10对SSR引物进行扩增，得到了67个等位基因。样品的SSR条带图谱如图1所示。
图1不同样品的SSR条带图谱
3.2遗传多样性分析
计算每个样品的遗传多样性参数，结果如表4所示。
表4不同样品的遗传多样性参数
3.3遗传关系分