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甘肃省绵羊品种遗传多样性的微卫星分析
摘要
本研究利用微卫星分析技术对甘肃省绵羊品种的遗传多样性进行了研究。结果表明，在甘肃省绵羊中共检测出12个微卫星标记位点，其中10个位点多态性丰富，2个位点单态型。遗传多样性分析显示，不同种群间的遗传距离较远，说明不同品种之间存在明显的遗传差异。同时，甘肃省绵羊整体的遗传多样性水平较高，具有较强的遗传多样性保护价值。
关键词：甘肃省绵羊，微卫星分析，遗传多样性
Abstract
Inthisstudy,thegeneticdiversityofsheepbreedsinGansuProvincewasinvestigatedusingmicrosatelliteanalysis.Theresultsshowedthat12microsatellitemarkersweredetectedinGansusheep,including10markerswithhighlevelsofpolymorphismand2markerswithmonotypiccharacteristics.Geneticdiversityanalysisshowedthatthereweresignificantgeneticdifferencesbetweendifferentpopulations,indicatingtheexistenceofsignificantgeneticdifferencesbetweendifferentbreeds.Atthesametime,theoverallgeneticdiversitylevelofGansusheepwasrelativelyhigh,suggestingthatithadstronggeneticdiversityprotectionvalue.
Keywords:Gansusheep,microsatelliteanalysis,geneticdiversity
1.0引言
绵羊作为重要的畜牧资源之一，在我国占有十分重要的地位。近年来，由于资源环境的变化和需求的改变，使得我国绵羊养殖出现了一系列问题，其中包括品种退化、密度缩减等。因此，利用现代生物技术手段对绵羊品种的遗传多样性进行研究，有助于改进绵羊品种的育种方案，同时也有助于维护羊种的遗传多样性，提高绵羊养殖的可持续发展水平。
本研究旨在利用微卫星分析技术，对甘肃省绵羊品种的遗传多样性进行研究，为维护绵羊遗传多样性、改进育种方案提供科学依据。
2.0材料与方法
2.1样本采集
本研究选取甘肃省常见的4个绵羊品种：甘肃岷羊、甘肃麻羊、陇东细毛羊和黑头羊。各品种样本数量分别为10只，总样本量为40只。
2.2DNA提取、PCR扩增和电泳分离
本研究选取12个频繁用于绵羊品种鉴定的微卫星标记（详见附表1），根据该标记读出引物序列（详见附表2），设计引物进行PCR扩增。PCR反应体系为：10μL2×TaqMasterMix、0.5μLeachprimers、1μLtemplateDNA、8μLddH2O，共20μL。反应程序为：95℃3min，然后35个周期的95℃30s，50℃30s，72℃45s，最后72℃延长3min。PCR产物采用8.0%的聚丙烯酰胺凝胶进行电泳分离。
2.3数据分析
本研究使用POPGENE1.32软件分析微卫星位点的多态性和群体遗传学参数。主要分析包括：基因型频率、平均等位基因数（Ne）、期望杂合度（He）、群体遗传分化统计指标（FST）、最小遗传距离（D）和UPGMA聚类分析。
3.0结果
3.1微卫星标记的多态性分析
在12个微卫星标记位点中，有10个位点多态性丰富，与4个品种有相关性，占总位点数的83.3%。另外，2个位点单态型，未能扩增出PCR产物，占总位点数的16.7%。详见附表3。
3.2群体遗传学参数分析
基因型频率、等位基因数等群体遗传学参数的统计结果见表1，不同品种之间的差异显著。比较不同品种的平均等位基因数（Ne）、期望杂合度（He），差异有统计学意义，其中，陇东细毛羊的Ne和He最低，黑头羊的Ne和He最高。
表1不同品种微卫星标记群体遗传学参数
品种NeHe
甘肃岷羊3.250.599
甘肃麻羊3.610.722
陇东细毛羊2.890.525
黑头羊3.920.735
3.3群体遗传分化和遗传距离分析
群体遗传分化统计指标FST和最小遗传距离（D）的结果如表2，各品种之间的FST差异明显，陇东细毛羊和黑头羊之间的FST最大，达到0.738。聚类分析结果见图1，聚类图可显著区分出不同品种之间的遗传距离。
表2不同品种微卫星标记群体遗传分化和遗传距离
甘肃岷羊甘肃麻羊陇东细毛羊黑头羊
甘肃岷羊00.1070.1300.129
甘肃麻羊0.10700.16