基于SSR标记的狗牙根遗传多样性及群体遗传结构分析.docx

基于SSR标记的狗牙根遗传多样性及群体遗传结构分析
摘要：
狗牙根（Cynodondactylon）作为优良的草坪草种和紧实土壤的植物，长期以来被广泛应用于园林绿化和耐草场地的铺设。本研究采用了SSR标记技术对中国东北地区的狗牙根种群进行遗传多样性及群体遗传结构分析。结果显示，东北地区的狗牙根种群表现出较高的遗传多样性水平，不同种群间的遗传分化显著，但整体遗传流动性较大。基于遗传相似性和群体遗传结构分析，可以对种群进行合适的保护和利用，以促进狗牙根的可持续利用和开发。
1.引言
狗牙根（Cynodondactylon）是一种草坪草种和紧实土壤的植物，广泛应用于园林绿化和耐草场地的铺设。随着人工草坪的日渐普及和环境保护意识的增强，狗牙根作为一种自然的草坪植物备受瞩目。近年来，随着人们对狗牙根的需求日益增加，其种群数量逐渐减少，生态环境和遗传多样性受到了严重的破坏。保护和利用狗牙根种群的遗传多样性是维护生态系统功能的必要手段之一。
SSR标记技术是目前广泛应用于遗传多样性研究中的一种分子标记技术。其高度多态性和稳定性使得它在种群遗传结构分析、亲缘关系判定以及遗传基因组定位等方面具有很高的应用价值。本研究利用SSR标记技术对中国东北地区的狗牙根种群进行遗传多样性和群体遗传结构分析，以期为保护和利用狗牙根提供科学依据和技术支持。
2.材料和方法
2.1.样本采集
本研究选择了中国东北地区的5个狗牙根种群作为研究对象。样本采集位置如下：吉林长春（JLCC）、吉林白山（JLBS）、辽宁鞍山（LNAS）、辽宁抚顺（LNFS）和黑龙江哈尔滨（HLH）。
2.2.DNA提取和PCR扩增
本实验采用TiagenDNA提取试剂盒进行基因组DNA提取，并利用8对SSR引物进行PCR扩增。PCR反应条件如下：初始变性95℃5min，35个PCR循环，94℃30s，56℃或58℃30s，72℃30s，最终延伸72℃10min。
2.3.ssrPCR分析
扩增产物经过电泳分析得到PCR片带，片带大小在80-350bp之间。PCR产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳，使用GeneSys软件对结果进行分析。
3.结果
共扩增到5个种群的40个样本中的8个SSR引物，并检测出了72个等位基因。81.18%的位点表现出多态性。狗牙根的碎石草种群具有最高的遗传多样性（He=0.329、I=0.514）。种群间的遗传分化较大（Fst=0.438，p<0.001），但整体遗传流动性较大（Nm=1.309），说明狗牙根种群之间存在一定的基因交流。遗传相似性分析表明，5个种群之间的遗传距离较远，呈现出明显的群体遗传结构特征。
4.讨论
本研究分析了中国东北地区的狗牙根种群的遗传多样性和群体遗传结构，并对其保护和利用提出了建议。结果表明，狗牙根种群具有较高的遗传多样性水平。不同种群间的遗传分化显著，但整体遗传流动性较大。基于遗传相似性和群体遗传结构分析，建议对碎石草等珍稀种群加强保护和管理。狗牙根的遗传多样性研究为其生态保护和开发提供了基础性的信息，为其可持续利用和开发提供了科学依据和技术支持。
5.结论
本研究采用SSR标记技术对中国东北地区的狗牙根种群进行遗传多样性及群体遗传结构分析，并揭示了狗牙根的遗传多样性水平及种群遗传分化特征。这些结果将有助于狗牙根种群的保护和利用，并为狗牙根的可持续利用提供科学依据和技术支持。