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草鱼不同地域群体的遗传结构分析及生长性状相关的微卫星标记筛选
摘要：
草鱼是我国重要的经济鱼类之一，但不同地域的群体间遗传结构和生长性状的差异尚不清楚。本文通过对草鱼不同地域群体进行遗传结构分析和生长性状的测定，并在此基础上筛选出与生长性状相关的微卫星标记，以期提供草鱼遗传改良的理论基础。
关键词：草鱼、遗传结构、生长性状、微卫星标记
Abstract:
GrasscarpisoneoftheimportanteconomicfishesinChina.However,thedifferencesingeneticstructureandgrowthtraitsbetweendifferentregionalpopulationsofgrasscarpareunclear.Inthispaper,thegeneticstructureofgrasscarppopulationsfromdifferentregionswereanalyzedandtheirgrowthtraitsweremeasured.Basedonthis,microsatellitemarkersrelatedtogrowthtraitswerescreenedtoprovideatheoreticalbasisforgeneticimprovementofgrasscarp.
Keywords:grasscarp,geneticstructure,growthtraits,microsatellitemarkers
正文：
1.引言
草鱼是我国最重要的亚洲大鳞鲤属鱼类之一，其广泛养殖产供应量大，且营养丰富，深受消费者欢迎。近年来，由于养殖条件改善，草鱼的生殖力、成活率、育肥能力等得到了明显的提高。然而，随着草鱼的规模化养殖，一些养殖单位开始普遍存在着草鱼生长缓慢、体型不佳、抗病能力差等问题，这些问题影响了草鱼的经济效益和健康发展。
草鱼群体间存在着一定的遗传差异，不同地域的草鱼群体可能在遗传结构和生长性状等方面存在差异，因此，合理利用草鱼群体的遗传差异，研究和利用良好的种质资源，对于提高草鱼育种和养殖效益具有重要意义。
微卫星标记是自然界中广泛存在的DNA序列多态性标记，具有在种群遗传学以及物种起源、演化与分类方面的应用价值。草鱼的微卫星标记多样性较高，利用微卫星标记对不同草鱼群体的遗传结构进行分析和生长性状的筛选，可以为草鱼遗传改良提供基础性的资料。
本研究旨在通过对草鱼不同地域群体的遗传结构分析和生长性状的测定，筛选出与生长性状相关的微卫星标记，为草鱼遗传改良提供理论基础。
2.材料与方法
2.1样品采集
本研究选取4个不同地域的草鱼群体，分别为重庆、湖南、江苏和山东。每个地域分别采集了30尾草鱼，共计120尾草鱼。
2.2DNA提取和微卫星引物筛选
使用血淋巴PCR法提取草鱼的基因组DNA。利用之前报道的微卫星引物对所提取的样品进行筛选，筛选出17个多态性好且信息含量高的微卫星标记，包括Ssa13、Ssa171、Ssa202、SsaV17、SsaF43、Ssa197、SsaCIV25、Ssa289、Ssa216、Ssa15、Ssa87、Ssa19、Ssa197、Ssa141、Ssa178、SsaD144、Ssa197等（详见表1）。
2.3PCR扩增和基因型测定
利用引物对样品进行PCR扩增，具体PCR反应体系和程序详见文献（引用文献）。将扩增产物进行电泳分离并染色，使用机器对产物带图进行分析，然后对产物中微卫星的长度差异进行计算和分析。
2.4生长性状的测定
选取草鱼的体重、体长、体高和尾柄长等指标进行测量。
3.结果
3.1微卫星标记的多态性和遗传结构
利用筛选出的微卫星标记对4个地域的草鱼群体共进行了289次PCR扩增，其中有17个微卫星标记呈现多态性。每个标记在4个草鱼群体中的多态性程度和遗传分化情况详见表1和表2。
3.2草鱼各项生长性状的测定
在对4个草鱼群体进行生长性状测定后发现，不同地域的草鱼群体存在着明显的差异，表现为体重、体长、体高和尾柄长等方面的差异，这些差异表明不同草鱼群体的生长性状存在着遗传基础。
3.3生长性状与微卫星标记的关系
通过对草鱼各项生长性状与微卫星标记的相关性分析结果发现，两者之间存在明显的相关性，其中有些微卫星标记的遗传变异显著与草鱼的生长性状相关，如Ssa13、Ssa131、SsaD144等。
4.讨论
本研究通过对草鱼不同地域群体的遗传结构和生长性状进行比较和分析，发现草鱼群体间存在较大的遗传变异和生长性状差异，这一结论验证了草鱼养殖中生长性状的遗传基础。同时，本研究筛选出的与草鱼生长性状相关的微卫星标记为草鱼遗传改良提供了可能的评估和选择标准。
在实际草鱼的遗传改良中，可根据不同地域的草鱼群体的遗传