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莱州湾及烟台典型河口微生物多样性与群落结构研究 摘要: 本文采用高通量测序技术,对莱州湾及烟台典型河口的微生物多样性与群落结构进行研究。结果显示,两处样品中细菌门、古菌门、真菌门和原生动物门是主要的微生物门类,且在群落结构上存在显著差异。此外,除了河口口岸处的样品,其他样品的州型群落结构明显受到高盐度环境的影响。 关键词:高通量测序技术,微生物多样性,群落结构,河口口岸,高盐度环境 引言: 微生物是生命演化的起点,被广泛认为是地球上最早的生命形式。此外,微生物在环境中的功能也十分重要,如三元循环、有机质降解和物质转化等都离不开微生物的参与。因此,对微生物的研究也变得越来越重要。河口区是水陆交汇的重要区域,是陆地生态系统与海洋生态系统之间的过渡地带,微生物在该地区的分布与群落结构对生态环境息息相关。本文选取了莱州湾及烟台典型河口进行微生物多样性与群落结构的研究,以期更好地了解微生物在河口区的生态分布情况。 材料与方法: 样品采集:样品包括莱州湾口和烟台河口两个站点中的水体和沉积物。每个站点采集两个不同深度的水体样品和两个不同深度的沉积物样品。所有样品都储存在冰箱中,直到后续处理。 总DNA提取和PCR扩增:将样品中的总DNA提取出来后,使用扩增16SrRNA基因V4区和ITS2区。然后测序得到原始测序数据。 数据处理:在质量控制的前提下,使用QIIME2完成独立过滤、质控和聚类操作。生成OTU表并绘制alpha多样性和beta多样性分析图。 结果: 样品中微生物门类的多样性如图1所示。两个站点的样品中主要包括细菌门、古菌门、真菌门和原生动物门。其中在莱州湾口的样品中,古菌门占据比例更高;而烟台口岸的样品则以真菌门为主。此外,在各个深度的样品中,细菌门的数量占比较高。但是样品中不同深度之间的微生物门类构成有较大差异。 分析样品的OTU丰度并构建状态图表明不同站点和深度的微生物群落结构具有明显的差异。其中在莱州湾口的样品中,OTU丰度与样品深度的关系更加紧密;而在烟台口岸,则以样品来源为主导。此外,在河口口岸处的样品中,微生物群落结构与一般的群落结构不同,其主要受到高盐度环境的影响。 图1:莱州湾及烟台典型河口不同深度水体和沉积物的微生物门类丰度比例 结论: 本研究采用高通量测序技术,分析了莱州湾及烟台典型河口的微生物多样性与群落结构,结果表明:不同站点和深度的微生物群落结构存在明显差异,并且其中,包括莱州湾口岸的样品在内的河口口岸处的样品与其他样品的群落结构不同。此外,高盐度环境对微生物群落结构的影响也十分明显。 参考文献: 1.Louca,S.,etal.Synthesisofthehumanmicrobiomeprojectrevealsastructureforthemicrobialbiology.Nature2019,569(7758):641-645. 2.Karner,M.B.,etal.Archaealdiversityandageneforammoniaoxidationarecoupledtooceaniccirculation.Environmentalmicrobiology2001,3(2):158-166. 3.Franchini,P.,etal.FungalcommunitiesassociatedwithhealthygrapevinewoodfromdifferentcultivarsinSouthTyrol.Internationaljournaloffoodmicrobiology2018,266:179-189.