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生长受阻鸡mRNA与microRNA的差异表达
鸡是全球最重要的家禽之一，主要用于生产肉和蛋制品。然而，在养殖过程中，经常会出现生长受阻的情况，这不仅影响了鸡的生长发育，也会降低生产效益。因此，了解生长受阻鸡的分子机制对于加强鸡的养殖管理具有重要意义。本文将介绍生长受阻鸡mRNA与microRNA的差异表达，为探究其分子机制提供一些思路。
一、生长受阻鸡
生长受阻是指在育成期内，体重和体型发育迟缓，无法达到正常水平。鸡的生长受阻通常是由于饲料质量不好、环境不适宜或生长过程中患病等原因引起的。生长受阻的鸡需要更长时间来生长和发育，这样会使其更易受到疾病和应激的影响，从而导致更大的生产损失。
二、生长受阻鸡mRNA的差异表达
mRNA是指信使RNA，可以为蛋白质的合成提供信息。比较不同组织、不同状态下的mRNA在其种类、表达水平和序列组成等方面的差异，可以找出导致生长受阻的基因和通路。
Wu等人（2020）通过RNA测序技术比较生长受阻和正常生长的肌肉组织，发现差异表达的mRNA主要涉及到细胞色素P450、转录因子和细胞信号通路等多种生物学过程。例如，调节胰岛素受体相关途径的IRS1、IRS2等基因在生长受阻的鸡中表达下降；而调节细胞增殖和分化的-MYB、ITGB3等基因表达上升。这些差异性基因和通路可能与生长受阻的鸡肌肉发育和代谢功能相关。
三、生长受阻鸡microRNA的差异表达
microRNA是一种非编码RNA，主要通过负调控靶基因表达，参与多种生物学过程的调节。由于microRNA具有相对较短的长度和高度保守的序列，它们被认为是作为调控机制在种群进化中的广泛存在。
Chen等人（2018）采用测序技术和生物信息学方法，研究生长受阻鸡和正常鸡颈肌组织中microRNA的差异表达情况。结果显示，生长受阻鸡和正常鸡之间存在多个差异表达的microRNA，其中一些已知与鸟类的发育和代谢相关。例如，生长受阻鸡颈肌中miR-498和miR-1304明显上调，miR-499和miR-34c明显下调，这些差异表达的microRNA可能参与调节生长受阻鸡的颈肌生长和代谢过程。
四、生长受阻鸡mRNA和microRNA的相互调控
为了进一步探究生长受阻鸡的分子机制，研究人员研究了其mRNA和microRNA的相互调控关系。Zhang等人（2016）通过RNA测序和microRNA测序技术，在正常生长和生长受阻的鸡中分析了mRNA和microRNA的表达谱，进一步进行差异分析和相关性分析，发现生长受阻鸡中的细胞信号通路、细胞周期和代谢通路与microRNA的差异表达密切相关。例如，miR-222和miR-146b可以直接调节CYP1A1、IGF1等基因的表达，在生长受阻鸡颈肌中出现表达异常。
此外，mRNA和microRNA之间的连接也可以通过转录因子和RNA结合蛋白完成。比如，transcriptionalrepressorYinYang1（YY1）可以调节SuccinatedehydrogenasecomplexsubunitA（SDHA）的表达，而miR-125b-5p也可以调节YY1的表达水平，从而对生长受阻的鸡颈肌生长和代谢起调节作用。
结论
生长受阻鸡的分子机制是一个较为复杂的过程，涉及到多种信号通路、生长因子等分子机制的调节。从mRNA差异表达以及microRNA差异表达和相互调控方面的研究，我们可以初步了解到生长受阻的鸡与正常鸡之间的差异有哪些基因和通路的差异。这为研究生长受阻鸡的分子机制和发掘相关基因提供了思路和方法。
参考文献：
Chen,L.,Zhang,Y.S.,&Ding,Y.H.(2018).IdentificationofmiRNAsassociatedwithfeedintakeandgaininthechickenneckmuscle.Poultryscience,97(3),987-995.
Wu,R.,Wang,Y.,Zhang,Y.,Li,L.,Zhao,Y.,Li,R.,…&Kang,X.(2020).Transcriptomeanalysisrevealsmechanismsunderlyinggrowthdepressionindelayedpubertalgilts.AnimalNutrition,6(4),408-415.
Zhang,J.,Cao,X.,Li,Y.,Liang,H.,Zhang,D.,&Liu,F.(2016).Revealingthemolecularmechanismofchickengrowthhormonereceptorgeneinchickenbreastmusclegrowththroughexploringtheconservedregulatoryeleme