猪不同发育阶段microRNA转录组的鉴定.docx

猪不同发育阶段microRNA转录组的鉴定
猪不同发育阶段microRNA转录组的鉴定
摘要
猪是重要的农业生产动物，并且在人类健康领域也有重要的意义。microRNA是一类长度较短的非编码RNA，可调节基因表达以影响生物体的发育、生理和病理过程。本研究对比分析了猪不同发育阶段（胚胎、新生猪和成年猪）的microRNA转录组，以期为了解猪身体发育和生长过程中microRNA的作用提供新的线索。
通过高通量测序技术，我们测定了由猪不同发育阶段组织分离所得的小RNA，并进行以下分析：鉴定、注释和基因本体论分类。我们在三个发育阶段共鉴定出857个microRNA，其中152个是新发现的。
我们进一步分析了这些microRNA的表达情况，比较了不同生长阶段的表达分布模式。结果表明，不同发育阶段猪体内microRNA的表达量差异很大。同时，在不同发育阶段之间，有许多microRNA表达量存在显著差异。从功能角度分析，这些microRNA主要参与调控细胞的生长、增殖和分化等过程，在猪身体发育和生长过程中发挥重要的作用。
在本研究中，我们发现一些重要的microRNA调控通路，如mTOR、TGF-β和Wnt等通路，这些通路在猪的身体发育和生长过程中发挥着重要的作用。本研究结果为进一步研究猪身体发育和生长过程中microRNA的作用提供了重要的参考。
关键词：猪；microRNA；转录组；发育阶段；mTOR；TGF-β；Wnt
Abstract
Pigsareimportantagriculturalproductionanimals,andhaveimportantsignificanceinhumanhealthaswell.microRNAsareatypeofshortnon-codingRNAthatcanregulategeneexpressiontoaffectthedevelopment,physiologyandpathologyoforganisms.ThisstudycomparedandanalyzedthemicroRNAtranscriptomeofpigsatdifferentdevelopmentalstages(embryos,pigletsandadults),inordertoprovidenewcluesforunderstandingtheroleofmicroRNAsinthebodydevelopmentandgrowthprocessofpigs.
Usinghigh-throughputsequencingtechnology,wemeasuredsmallRNAsisolatedfromtissuesatdifferentdevelopmentalstagesofpigs,andperformedidentification,annotationandgeneontologyclassificationanalysis.Weidentified857microRNAsinthreedevelopmentstages,ofwhich152werenewlydiscovered.
WefurtheranalyzedtheexpressionofthesemicroRNAsandcomparedtheexpressiondistributionpatternsatdifferentgrowthstages.TheresultsshowedthatthereweresignificantdifferencesintheexpressionlevelsofmicroRNAsinpigatdifferentdevelopmentalstages.Atthesametime,thereweremanymicroRNAswithsignificantlydifferentexpressionlevelsbetweendifferentdevelopmentalstages.Fromafunctionalperspective,thesemicroRNAsparticipatemainlyintheregulationofcellgrowth,proliferationanddifferentiation,playinganimportantroleinthedevelopmentandgrowthprocessofpigs.
Inthisstudy,wefoundsomeimportantmicroRNAregulatorypathways,suchasmTOR,TGF-βandWntpathways,whichplayimportantrolesinthebodydevelopmentandgrowthp