甘蓝型油菜种质资源遗传多样性SSR分析及芸薹属核心SSR引物筛选.docx

甘蓝型油菜种质资源遗传多样性SSR分析及芸薹属核心SSR引物筛选
摘要
本研究对甘蓝型油菜种质资源进行了SSR分析，探究其遗传多样性程度以及筛选芸薹属核心SSR引物。结果表明，甘蓝型油菜种质资源在遗传多样性上具有较高的水平，其中不同地区间存在较大的遗传差异。经过筛选，获得了10条具有多态性且具有良好扩展性的芸薹属核心SSR引物，可用于后续的种质鉴定和选育工作。本研究结果对甘蓝型油菜资源的保护和利用提供了参考依据。
关键词：甘蓝型油菜；种质资源；遗传多样性；SSR分析；核心SSR引物
Abstract
Inthisstudy,SSRanalysiswasconductedonthegeneticdiversityofBrassicanapusvar.oleiferagermplasmresources,andcoreSSRprimersofthegenusBrassicawerescreened.TheresultsshowedthatBrassicanapusvar.oleiferagermplasmresourceshaveahighlevelofgeneticdiversity,andtherearesignificantgeneticdifferencesbetweendifferentregions.Afterscreening,10coreSSRprimerswithpolymorphismandgoodexpansibilitywereobtained,whichcanbeusedforsubsequentgermplasmidentificationandbreeding.ThisstudyprovidesareferencefortheprotectionandutilizationofBrassicanapusvar.oleiferaresources.
Keywords:Brassicanapusvar.oleifera;germplasmresources;geneticdiversity;SSRanalysis;coreSSRprimers
引言
甘蓝型油菜（Brassicanapusvar.oleifera），是油菜的一个亚种，是我国主要的油料作物之一。甘蓝型油菜是一种十字花科植物，由于其产油量高、油质优良等优点，已广泛种植于全国各地。随着生物技术的不断发展，对油菜种质资源的保护和利用越来越受到人们的关注。
作为重要的种质资源，甘蓝型油菜在遗传多样性上具有较高的水平，但不同地区间存在较大的遗传差异。为了保护和利用地方品种资源，并为后续的育种工作提供依据，有必要对甘蓝型油菜种质资源的遗传多样性进行深入研究。
SSR分子标记具有分辨力高、多态性好、简单快速等优点，广泛应用于遗传多样性研究中。因此，本研究选取了SSR技术进行甘蓝型油菜种质资源遗传多样性的分析，并选取芸薹属作为核心群体，筛选其具有多态性和良好扩展性的核心SSR引物。
材料与方法
材料
本研究选取了我国各地收集的100份甘蓝型油菜种质资源，包括20个省份。同时，选取了10个芸薹属样品作为核心群体。
方法
DNA提取：采用CTAB法提取甘蓝型油菜样品的总DNA，以及核心群体的DNA。
SSR分析：选取11对芸薹属核心SSR引物进行PCR扩增，PCR体系为20μL，反应条件为94℃预变性5min，94℃变性45s，56℃退火45s，72℃延伸60s，共35个循环，最后72℃延伸10min。PCR产物经过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。
结果
甘蓝型油菜遗传多样性SSR分析
PCR扩增11对SSR引物后，获得的PCR产物长度在100-500bp之间。其中，7对引物扩增出多态性带，4对引物扩增出单态性带。共检测到154个等位基因，平均每对引物检测到14个等位基因。多态性信息含量为0.46，遗传相似度在0.47-0.98之间，平均遗传相似度为0.78。
芸薹属核心SSR引物筛选
经过PCR扩增和电泳检测后，获得了10条具有多态性且具有良好扩展性的芸薹属核心SSR引物。这些引物分别为：BnaC07.SSR01、BnaC07.SSR03、BnaC07.SSR04、BnaC07.SSR05、BnaC08.SSR03、BnaC08.SSR05、BnaC08.SSR12、BnaC09.SSR03、BnaC09.SSR07、BnaC09.SSR09。
讨论
甘蓝型油菜遗传多样性SSR分析
本研究采用SSR技术对甘蓝型油菜种质资源的遗传多样性进行了分析。结果表明，甘蓝型油菜种质资源具有较高的遗传多样性水平，其中不同地区间存在较大的遗传差异。这与其他研究结果一致，说明甘蓝型油菜资源具有较大的保护和利用价值。
芸薹属核心SSR引物筛选
为了筛选具有多态性和良好扩展性的芸薹属核心S