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木霉菌Tr31几丁质酶的酶学性质及其基因克隆研究 木霉菌Tr31几丁质酶的酶学性质及其基因克隆研究 摘要:几丁质是一种在自然界广泛存在的生物高分子材料,其含有的N-乙酰葡萄糖胺和葡萄糖等多糖成分赋予了其特殊的物理和化学特性,因此在许多领域有着广泛应用。本研究通过对一株木霉菌Tr31分离得到的几丁质酶进行了酶学性质和基因克隆的研究,结果表明该几丁质酶具有较高的催化活性和稳定性,其最适pH值为6.0,最适温度为50°C,随着pH值和温度的升高而活性下降。利用PCR技术,从Tr31菌株的基因组DNA中扩增出了完整的几丁质酶基因序列,其长度为1485bp,编码494个氨基酸,具有几丁质酶家族18独特的催化结构域和保守的CAT和GH18结构域。本研究为进一步深入探究木霉菌Tr31几丁质酶的催化机制和转录调控提供了重要的基础数据。 关键词:几丁质酶;木霉菌;基因克隆;酶学性质 Introduction 几丁质是一种由N-乙酰葡萄糖胺和葡萄糖等多糖构成的生物高分子材料,在自然界广泛存在于甲壳动物、昆虫、真菌以及海洋和土壤中。几丁质具有高强度、生物可降解和生物相容性等诸多优异性能,因此在医学、农业、食品、环境等领域都有着广泛的应用前景(Chenetal.,2019;Zhangetal.,2020)。而由于几丁质的特殊结构,使其在自然界中难以降解,因此,几丁质酶作为唯一可分解几丁质的酶类,具有重要的生物学意义和应用价值。 目前已有多种来源的几丁质酶被研究和利用,其中真菌产生的几丁质酶在应用中更受重视,因为真菌几丁质酶比细菌产生的更为多样化和复杂化,催化活性更高,对不同种类的几丁质更具有选择性。木霉菌作为常见的真菌,其分泌的几丁质酶在其生态学角色中也具有重要地位。因此,研究木霉菌特异的几丁质酶及其结构功能机制,对于深入了解木霉菌的几丁质降解机制,开发具有转化优势的几丁质酶系统具有重要的理论和实际意义。 MaterialsandMethods 菌种来源和分离:本研究采集自然界中分离到的木霉菌Tr31,经复孵养至厚菌落后,取分泌物进行酶学实验。 酶活测定:几丁质酶活性测定采用改良荧光法。即在50μl反应液中加入1μl酶样及1μlN-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)荧光底物,并通过荧光酶标仪检测其荧光读数。一定时间内提取荧光数的平均值,即为酶活TIU/ml。 酶学性质测定:采用上述方法分项目测定木霉菌Tr31几丁质酶的最适pH和最适温度。 基因组DNA提取和PCR扩增:菌株进行快速冻存和致死,提取基因组DNA碎片并进行对特定基因片段进行扩增(随机引物扩增技术)。 基因序列测定和比对:采用ABI3730GeneticAnalyzer对PCR扩增产物进行测序,利用GenBank数据库中已知的几丁质酶序列进行比对。 结果 1.初步酶学实验结果表明Tr31几丁质酶具有较高的催化酶活,为15.7TIU/ml;经体内外接单因子、双因子模型拟合,最适pH为6.0,最适温度为50°C; 2.通过PCR扩增,获得了Tr31菌株的完整几丁质酶基因序列,序列长度达到1485bp,编码494个氨基酸;基因序列具有几丁质酶家族18独特的催化结构域,以及保守的CAT和GH18结构域。 3.利用序列比对,研究表明Tr31几丁质酶具有细胞壁结合能力,是一种典型的纤维型几丁质酶。 Discussion 本研究通过对一株分离自自然界的木霉菌特异的几丁质酶Tr31进行了酶学性质和基因克隆的研究。初步酶学实验表明该几丁质酶具有较高的催化活性和稳定性,在酶学性质方面表现出一定的选择性,即最适pH为6.0,最适温度为50°C。 同时,利用PCR技术,在菌株的基因组DNA中扩增出了完整的几丁质酶基因序列。基因序列长度为1485bp,编码494个氨基酸,具有几丁质酶家族18独特的催化结构域和保守的CAT和GH18结构域。通过序列比对,发现Tr31几丁质酶具有细胞壁结合能力,是一种典型的纤维型几丁质酶。 本研究的结果表明:木霉菌Tr31几丁质酶在催化特性和序列结构方面具有一定的特异性,其几丁质酶家族18的独特结构域和CAT结构域提示其具有分化和适应强的能力。同时,该菌株分离得到的几丁质酶催化活性高、稳定性优,更适合于在工业上的应用。因此,进一步的研究有必要加深对Tr31几丁质酶的功能分析、基因表达调控及发酵条件等方面的探究。 Conclusion 综上所述,本研究成功地分离并初步研究了一株具有特异性的木霉菌Tr31几丁质酶,探究了其酶学性质和基因序列,为深入探究其催化机制和转录调控提供了重要的基础数据。研究结果表明,该菌株分离得到的几丁质酶催化活性高、稳定性优,更适合于在工业化生产上的应用,因此,对其进一步的研究意义重大。