基于加权基因共表达网络的肿瘤中特异表达基因筛选方法研究的任务书.docx

基于加权基因共表达网络的肿瘤中特异表达基因筛选方法研究的任务书
任务书
题目：基于加权基因共表达网络的肿瘤中特异表达基因筛选方法研究
背景：
随着分子生物学、生物信息学、系统生物学等技术的不断发展，人们对癌症的认识和治疗方式也在不断进步。但是癌症的深层次发病机制仍然是一个研究难点，而肿瘤中的特异表达基因往往是其发病机制的重要组成部分。
目标：
本研究旨在通过构建加权基因共表达网络，利用网络拓扑结构和生物信息学方法来筛选出肿瘤中的特异表达基因，为深入研究肿瘤的发病机制提供新的思路和手段。
研究内容：
首先，通过整合公共数据库中的肿瘤基因表达数据，构建加权基因共表达网络，并对网络进行拓扑分析和生物学意义上的功能注释，进一步筛选出重要的网络特征基因。
其次，利用加权基因共表达网络中节点之间的相互作用关系，结合遗传变异、转录因子网络及mRNA-microRNA互作网络等分析方法，筛选出肿瘤中的特异表达基因。
最后，通过实验证实所筛选出的基因在肿瘤细胞中的表达变化及其作用机制，验证筛选方法的有效性以及其在深入研究癌症发病机制中的应用价值。
研究意义：
本研究的成果将为肿瘤发病机制的深入研究和肿瘤靶向治疗提供新的模型和思路，有望为癌症的早期诊断和定位提供新的技术手段，同时也将为其他疾病的相关研究提供借鉴和参考。
计划安排：
第一年：
1.收集肿瘤基因表达数据，构建加权基因共表达网络；
2.对网络进行拓扑分析和功能注释，筛选出重要的网络特征基因；
3.结合遗传变异、转录因子网络及mRNA-microRNA互作网络等分析方法，筛选出肿瘤中的特异表达基因。
第二年：
1.分析和验证所筛选出的基因在肿瘤细胞中的表达变化；
2.研究所筛选基因的作用机制；
3.验证筛选方法的有效性。
第三年：
1.总结分析研究成果；
2.撰写学术论文和相关专利；
3.开展学术讲座，宣传研究成果和科研方法。
预期成果：
1.构建加权基因共表达网络，筛选出肿瘤中的特异表达基因；
2.验证筛选方法的有效性；
3.解析所筛选基因的作用机制，为肿瘤发病机制的深入研究和治疗提供新的思路和手段；
4.发表2篇以上SCI学术论文。