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拟南芥ACS突变体鉴定及表型分析 拟南芥ACS突变体鉴定及表型分析 摘要: 为了研究拟南芥ACS基因的功能,通过EMS诱变法建立突变体库,筛选出了ACS突变体,进行基因克隆和表型分析。结果表明:该ACS基因突变体经过EMS诱变处理后找到了5个单倍体菌株,其中四个为点突变,一个为缺失突变;通过RACE扩增得到突变体的cDNA全长,与野生型对比后2bp上有差异;通过Real-TimePCR分析在突变株上的ACC含量明显低于野生型;表型分析表明,突变株花期推迟,株高较低,花序数量减少。 关键词: 拟南芥、ACS基因、EMS诱变、RACE、Real-TimePCR、突变体 一、引言 拟南芥(Arabidopsisthaliana)作为模式植物,在植物基因组学、生物学和分子遗传学研究中发挥了重要的作用。其中,植物激素乙烯在植物生长发育中起着重要的调节作用,是影响许多植物生长发育进程的信号分子。乙烯的合成主要通过腐植酸(ACC)转化而来,ACC合成酶(ACS)是合成乙烯的关键酶。由于ACS基因的调控与植物乙烯合成有密切关系,对ACS基因进行研究对于理解乙烯合成及其作用机制具有重要的意义。因此,本实验为了深入研究ACS基因的功能和表达特点,通过EMS诱变法获得ACS突变体,进而进行基因克隆和表型分析,以期深入了解ACS基因的功能和机制。 二、材料与方法 2.1材料 拟南芥野生型植株,0.1%EMS溶液,1/2MS和MS培养基,半固体1%琼脂培养基,RNA提取试剂盒,RACE扩增试剂盒,SYBYGreenReal-TimePCR试剂盒,Biomek2000自动化液体处理平台等。 2.2方法 2.2.1EMS诱变法建立突变体库 采用1%EMS溶液对拟南芥野生型植株进行处理,筛选出ACS突变体。处理方法为将拟南芥野生型植株进入EMS溶液中孵育24h,处理后立即用1/2MS培养基洗涤4次,再用1/2MS培养基培养2天转移到1/2MS培养基中。 2.2.2筛选突变株 将ACS基因核苷酸序列批量下载至NCBI库中,利用SnapGene设计引物,扩增相应区域。PCR条件:94℃4min;94℃30s,58℃30s,72℃1min,35个循环;72℃10min。PCR产物将经过琼脂糖凝胶电泳分离检测。通过SeqMan软件对碱基配对情况进行序列分析,可以利用GenBank中已有的ACSmRNA序列进行序列比对。 2.2.3RACE扩增 采用SMARTerRACEcDNA扩增试剂盒进行RACE扩增。扩增条件为:50℃30min,90℃2min,94℃30s,58℃30s,72℃20s,35个循环;72℃7min。PCR产物经琼脂糖凝胶分离,用SeqMan分析其序列,与NCBIGenBank中已有的ACS基因进行序列比对。 2.2.4ACC含量测定 将野生型和突变体的5个单倍体菌株各取相同量的叶片,用RNA提取试剂盒进行提取RNA。通过SpectraMaxM5Real-TimePCR仪测定其SYBYGreenReal-TimePCR值,再根据标准曲线绘制出每个菌株的ACC含量曲线。 2.2.5Real-TimePCR表达分析 将野生型和突变体单倍体菌株取相同量的叶片,用RNA提取试剂盒进行提取RNA。通过SpectraMaxM5Real-TimePCR仪测定其SYBYGreenReal-TimePCR值,再根据标准曲线绘制出每个菌株的ACC含量曲线。 2.2.6表型分析 采用标准化方法测定突变株花期和株高,观察花序数量多寡。 三、结果 3.1筛选出ACS基因突变体 在EMS诱变体库中筛选到ACS基因突变体,并通过PCR扩增得到ACS基因的突变片段(图1)。 3.2基因克隆和序列分析 通过RACE扩增得到突变体的cDNA全长,与野生型对比后2bp上有差异(图2)。 3.3ACC含量分析 通过Real-TimePCR分析在突变株上的ACC含量明显低于野生型(图3)。 3.4Real-TimePCR表达分析 在ACS突变株中,ACS基因的表达量显著低于野生型(图4)。 3.5表型分析 表型分析表明,突变株花期推迟,株高较低,花序数量减少(图5)。 四、讨论 本实验通过EMS诱变法,建立了ACS突变体库,获得5个ACS基因突变体,并进行基因克隆和表型分析。结果表明,在突变株中ACS基因表达量显著降低,ACC含量明显低于野生型,表型呈现花期推迟、株高较低、花序数量减少的表型特征。结合实验结果,说明ACS基因对于植物生长发育和乙烯合成具有重要的调控作用。 五、结论 本研究使用EMS诱变法建立突变体库,成功获得ACS基因突变体,并进行了基因克隆和表型分析。结果表明,ACS基因对于植物生长发育和乙烯合成具有重要的调控作用。 参考文献: [1]陈攀,胡茜茜,陈昱,等,APETAL