基于DGGE技术的乌梁素海湖滨湿地细菌群落结构分析的任务书.docx

基于DGGE技术的乌梁素海湖滨湿地细菌群落结构分析的任务书
任务书
一、任务背景
湿地生态系统是世界上最重要、最脆弱的生态系统之一，也是全球生物多样性最丰富的生态系统之一。湿地生态系统的维持依赖于其中的微生物群落，微生物可以在湿地中起到关键的异化作用。因此，对于湿地生态系统微生物群落结构的研究具有十分重要的意义。
借助分子生物技术的发展，能够通过DNA指纹技术来研究微生物群落的结构。聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术可以用来分析环境微生物群落结构，是一种快速、灵敏、直观的微生物群落分型技术。
二、任务目的
本次任务旨在基于DGGE技术对乌梁素海湖滨湿地细菌群落结构进行分析，探究其微生物群落的多样性、组成和群落结构。
三、任务内容
1.采样：在乌梁素海湖滨湿地不同样点取样，共采集10个样品，分别采集不同时间段，收集样品包括表层水、表层泥沙以及根层土壤。
2.DNA提取：使用分子生物学技术将采样到的样品的DNA进行提取，确保DNA提取的完整性。
3.PCR扩增并DGGE分析：将DNA进行PCR扩增并进行DGGE分析，通过可视化处理，得到细菌DGGE指纹图谱并进行相应的数据处理和分析，获取各样品之间的差异性并进行样品聚类分析。
4.数据统计与分析：对所有指纹图谱进行数据统计和分析，运用生态学原理和方法进行相关分析，比如物种多样性指数分析和NMDS分析等。
5.结果表述：将分析的结果进行整理、归纳和表述，撰写研究报告，说明微生物群落结构的多样性、组成和群落结构，揭示湿地生态系统中的微生物生态学规律。
四、任务要求
1.实验前需要充分了解PCR-DGGE技术和微生物群落分析的相关知识和方法，并具备实验操作技能和数据处理能力；
2.样品采集时需遵循规范、标准的采样方法，确保采样样品无任何污染；
3.实验过程需要做好质控工作，确保数据的准确性和可靠性，并记录实验数据和结果；
4.要求完成研究报告，并能够进行书面表述和图表绘制，保证研究报告的完整性、准确性和可读性。
五、参考文献
1.HanZ.,HaoY.,LiP.,GuoH.,JiL.,WangH.,etal.(2015).Effectsoflong-termfertilizationonsoilmicrobialdiversityinahumicCambisol.JournalofSoilsandSediments,15(1):131–137.
2.YangY.,ZhangJ.,LiuS.,WangZ.,LiangX.,ShiY.,etal.(2016).Effectsofland-useconversiononbacterialdiversityandcompositioninthesubtropicalzoneofChina.SoilBiologyandBiochemistry,99:107–116.
3.LiX.,LiY.,DingW.,WangY.,ZhangZ.(2019).Changesincarbonsourceutilizationandbacterialcommunitystructureinpaddysoilunderlong-termfertilization.JournalofSoilsandSediments,19(4):1641-1653.
4.TeixeiraL.C.,PeixotoR.S.,CuryJ.C.,SulW.J.,PellizariV.M.,TiedjeJ.,etal.(2010).BacterialdiversityinrhizospheresoilfromAntarcticvascularplantsofAdmiraltyBay,maritimeAntarctica.TheISMEJournal,4(7):989–1001.