向日葵SRAP分子标记遗传连锁图谱的构建的任务书.docx

向日葵SRAP分子标记遗传连锁图谱的构建的任务书
任务书
任务名称：向日葵SRAP分子标记遗传连锁图谱的构建
任务目的：
1.建立向日葵的分子标记遗传连锁图谱，探究相关基因与性状的关系；
2.提升向日葵的遗传育种水平，为向日葵的遗传改良和培育提供科学依据。
任务内容：
1.采集不少于100个向日葵品种/材料进行分析；
2.使用SRAP（Sequence-relatedamplifiedpolymorphism，序列相关扩增多态性）技术对采集到的向日葵样品进行分子标记分析，得到一组SRAP分子标记数据；
3.对SRAP分子标记数据进行数据挖掘和分析，包括遗传多样性、群体结构、遗传距离等分析，得到一组遗传信息；
4.利用软件QTLCartographer将SRAP分子标记数据转化为连锁图谱，得到一组遗传连锁图谱；
5.结合性状数据对遗传连锁图谱进行QTL分析，挖掘出与性状相关的候选基因。
任务实施：
1.采集与处理样品：采集各种类型的向日葵植株，对植株进行信息登记并进行简单鉴定，收集稳定性强、遗传背景多样的样本进行进一步的分析。
2.SRAP分子标记数据分析：根据SRAP技术的特点，进行PCR扩增和电泳分离，得到以DNA片段为基础的SRAP分子标记数据；对数据进行质控、分子标记定位和分型等工作，得到一组可靠的SRAP分子标记数据。
3.遗传信息分析：对采集到的数据进行遗传多样性、群体结构分析、遗传距离计算等，形成详细的遗传信息。
4.连锁图谱构建：将SRAP分子标记数据输入QTLCartographer软件中，进行连锁图谱构建，利用标记距离和连锁分析方法构建一个可靠的遗传连锁图谱。
5.QTL分析：将连锁图谱与性状数据相结合，进行QTL分析，挖掘出与性状相关的候选基因，为遗传改良和培育奠定科学基础。
任务组织：
1.团队组成：由有遗传学、分子生物学专业背景的科研和技术人员组成，负责采样、实验、分析和结果解读等环节。
2.工作流程：首先，进行样品的采集和处理，得到一批样品并登记样品信息；然后，利用分子标记技术，得到一组SRAP分子标记数据；接着，对SRAP分子标记数据进行数据挖掘和分析，得到一组遗传信息；随后，采用软件QTLCartographer进行SRAP数据转化为连锁图谱，并利用性状数据进行QTL分析；最终，将实验结果进行统计和分析，得出相应的结论。
任务时间：
预计任务周期为2年，分为以下几个阶段：
阶段一（1年）：采样、分子标记、遗传信息分析；
阶段二（1年）：连锁图谱构建、QTL分析、结果解读和统计。
任务经费：
预计该任务经费为200万元，其中，包括采样、实验、人员、设备等各项支出。其中，采样和样本处理费用为20万元，分子标记和遗传信息分析费用为50万元，连锁图谱构建和QTL分析费用为100万元，人员和设备支出为30万元。