动脉粥样硬化相关lncRNA表达谱分析及初步筛选的任务书.docx

动脉粥样硬化相关lncRNA表达谱分析及初步筛选的任务书
任务书
任务名称：动脉粥样硬化相关lncRNA表达谱分析及初步筛选
任务背景：
动脉粥样硬化是指血管壁发生病理性变化，使得血管腔狭窄，血流受到阻碍，导致多种心血管疾病的发生，如心绞痛、心肌梗死、脑卒中等。长链非编码RNA（lncRNA）在调控基因表达及调节疾病发生中起着重要作用。国内外不少研究发现lncRNA在动脉粥样硬化发生中有一定的参与，但相关研究仍不够深入，需要进一步的实验和分析。
任务目的：
通过对动脉粥样硬化患者的生物标本进行lncRNA表达谱的分析，筛选与动脉粥样硬化相关的lncRNA，为进一步研究动脉粥样硬化的发生机制提供参考。
任务要求：
1.收集动脉粥样硬化患者的生物标本，提取RNA进行转录组测序，获取lncRNA表达数据；
2.通过生信分析工具对RNA测序数据进行初步质控、比对和定量，计算表达量，筛选出表达差异显著的lncRNA；
3.在组织样本中对筛选出来的lncRNA进行实时荧光定量PCR验证，确认表达差异的可靠性；
4.对差异显著的lncRNA进行生物信息学分析，包括lncRNA表达调控通路、基因共表达网络等分析，进一步的了解lncRNA在动脉粥样硬化中的生物学意义。
5.根据实验结果初步筛选出能够作为动脉粥样硬化治疗靶点或诊断标识的lncRNA，为进一步的研究提供科学依据。
任务时间：
本次任务预计用时3个月，具体时间安排如下：
-1个月时间进行生物样本的收集、RNA提取、测序等实验操作；
-1个月时间进行RNA测序数据的初步处理和分析；
-2周时间进行实验结果的验证和生物信息学分析；
-最后1周时间撰写实验结果、分析报告，完成任务。
任务经费：
本次任务经费为20000元人民币，主要包括样品采集、RNA提取、RNA测序、PCR实验、数据分析等费用。
任务成果：
1.一份详细的实验报告，内容包括实验设计、样本采集、RNA提取、测序数据质量控制、基因表达谱分析、生物信息学分析、结果讨论和结论等。
2.一个能够作为动脉粥样硬化治疗靶点或诊断标识的lncRNA列表，以及相关的生物信息学分析结果和图表。
3.原始数据和分析流程的共享，符合规范的数据格式和架构，数据可供相关研究人员使用和验证。
参考文献：
1.ZhuMM,LiuLY,LiXL,etal.TheFootprintofLipidMetabolisminVascularStenosis:AMulti-OmicsAnalysis[J].Theranostics,2021,11(4):1832-1853.
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