RNA结合蛋白对可变剪接和非经典翻译的调控研究的任务书.docx

RNA结合蛋白对可变剪接和非经典翻译的调控研究的任务书
任务书
课题名称：RNA结合蛋白对可变剪接和非经典翻译的调控研究
课题背景
RNA结合蛋白是一类重要的转录后调控因子，它们广泛参与了可变剪接、非经典翻译和mRNA稳定等过程。这些过程都是关键的细胞功能调节机制，对于细胞增殖、分化、发育以及应激反应等方面至关重要。因此，RNA结合蛋白的研究具有重要的生物学和医学意义。
课题任务
本课题旨在通过对RNA结合蛋白的研究，探讨其对可变剪接和非经典翻译的调控作用，并从分子水平阐明相应的机制。具体任务分为以下三个部分：
1.高通量测序分析RNA结合蛋白对可变剪接的调控
使用CLIP-seq技术，筛选出参与可变剪接调控的RNA结合蛋白，利用RNA-seq技术对其调控下游基因的可变剪接进行分析。并在不同发育阶段、不同组织和不同应激条件等情况下，研究RNA结合蛋白对可变剪接的调控变化规律，从而揭示RNA结合蛋白参与可变剪接的分子机制。
2.RNA结合蛋白在非经典翻译中的作用及其调控机制的研究
利用Ribo-seq技术，探究RNA结合蛋白在非经典翻译中的作用，并通过多种生物信息学方法，分析其在翻译水平上的调控途径和分子机制。同时，在细胞培养模型中构建RNA结合蛋白的表达修饰体系，研究RNA结合蛋白对非经典翻译的作用，并系统分析其作用机制。
3.RNA结合蛋白介导的mRNA稳定性调控机制研究
使用PAR-CLIP技术筛选出参与mRNA稳定性调控的RNA结合蛋白，并利用RNA-seq技术分析其对mRNA稳定性的调控作用。通过构建稳定性记者基因和RNA结合蛋白表达修饰体系，从细胞内部分子水平研究RNA结合蛋白的内在调控机制，进而揭示RNA结合蛋白调控mRNA稳定性的分子机制。
课题要求
1.熟练掌握RNA分子生物学实验技术，如RNA结合蛋白的克隆、表达及组蛋白免疫共沉淀等技术，并能独立进行实验和数据分析；
2.熟悉常用高通量测序和生物信息学分析方法，如CLIP-seq、RNA-seq、Ribo-seq和PAR-CLIP及其相关数据分析和挖掘工具，能够进行数据处理、统计分析和模式识别；
3.熟悉细胞培养和转染技术，有较为扎实的实验技能和动手能力；
4.具备良好的团队合作意识和沟通能力，能够按时完成课题任务，并能够撰写高质量的学术论文。
预期成果
1.发表不少于4篇SCI学术论文，其中至少1篇在专业领域重要期刊或高影响因子期刊上发表；
2.在研究领域具有一定的学术声誉和影响力；
3.能够为RNA后转录修饰研究的发展和实践提供有益的经验和借鉴。
参考文献
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