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MicroRNA识别中的若干关键技术研究任务书 任务书 题目:MicroRNA识别中的若干关键技术研究 背景和意义: 随着生物信息学、计算机科学等领域的高速发展,MicroRNA识别技术已经成为了当前生物信息学研究领域中的热门话题之一。MicroRNA是一类具有重要调控功能的非编码RNA,对于细胞和生物体的发育、生长以及免疫等方面起着至关重要的作用。因此,发掘和识别MicroRNA具有非常重要的科学价值和实际应用前景。 对于MicroRNA识别技术的研究,可以分为两大类:实验方法和计算方法。其中,实验方法主要是通过细胞培养、RNA纯化、Northernblot等实验手段来鉴定MicroRNA。这种方法具有较高的准确性和可靠性,但需要大量的人工和物力投入,并且识别速度较慢。而计算方法则是利用计算机算法来实现MicroRNA识别,具有自动化、高效率、低成本等优点。目前,计算方法已经成为MicroRNA识别的主要手段,包括了基于序列和结构特征的算法、机器学习等方法。但是,目前仍然存在一些问题需要解决,这些问题既包括理论方面,也包括实践方面,因此有必要对MicroRNA识别中的若干关键技术进行深入研究。 任务目标: 本次任务旨在对MicroRNA识别中的若干关键技术进行深入研究,包括但不限于以下几个方面: 1.基于序列和结构特征的MicroRNA识别算法优化 目前,基于序列和结构特征的MicroRNA识别算法已经取得了一定的成果。但是,这些算法仍然存在一些局限性,如准确性不高、无法处理新的未知MicroRNA等问题。因此,需要通过改进算法和增加特征来提高算法的准确性,同时能够处理新的未知MicroRNA。 2.机器学习算法在MicroRNA识别中的应用研究 机器学习算法在MicroRNA识别研究中也取得了一定成就。但是,这些算法也存在一些问题,如部分数据噪声、模型偏差、数据量不足等问题。对于这些问题需要从算法和数据两个方面进行改进和优化。 3.基于深度学习的MicroRNA识别算法研究 深度学习在图像、自然语言处理等领域取得了很大的进展,而在生物信息学领域的应用也越来越受到关注。因此,开发一种基于深度学习的MicroRNA识别算法也是非常有意义的研究方向,但是也需要克服过拟合、深度不足等问题。 4.特定物种MicroRNA识别的算法研究 MicroRNA具有种属特异性,因此,针对特定物种的MicroRNA识别算法也是非常有价值的研究方向。但是,目前特定物种MicroRNA鉴定一直以来存在数据量不足、准确性不高等问题,需要通过合适的算法和数据处理方法来解决。 任务成果: 1.基于序列和结构特征的MicroRNA识别算法优化原理和算法。 2.机器学习算法在MicroRNA识别中的应用研究文章。 3.基于深度学习的MicroRNA识别算法研究文献。 4.特定物种MicroRNA识别的算法研究方法和结果。 任务分工: 1.姓名:XXX,负责任务目标1的研究和成果的撰写。 2.姓名:XXX,负责任务目标2的研究和成果的撰写。 3.姓名:XXX,负责任务目标3的研究和成果的撰写。 4.姓名:XXX,负责任务目标4的研究和成果的撰写。 时间安排: 本次任务的总时间为3个月,具体时间安排如下: 第1-2周:确定任务目标和任务分工,撰写任务书 第3-10周:对任务目标进行深入研究,并撰写研究报告 第11-12周:整理、编辑和修订研究报告,提交成果 注:以上时间安排为参考,如有特殊情况可适当调整。 经费预算: 本次任务的经费预算为5000元人民币,主要用于实验材料的采购、计算机资源的租用、文献检索等方面。具体经费使用情况需要按照实际需求进行合理安排和使用。 参考文献: 1.D.Yin,Q.Jiang,Y.Liao,etal.AcomparisonofcomputationalmethodsfordetectingmiRNAloci.BmcGenomics,2016,17. 2.LanX,ZhangGJ,XiaoZD.etal.IdentificationofMicroRNAswithEssentialRolesinHepatocellularCarcinoma.Brazilianjournalofmedicalandbiologicalresearch=Revistabrasileiradepesquisasmedicasebiologicas,2019,52(4):e8082. 3.GengY,ChenS,GuanC.etal.AnovelhybridapproachforMicroRNAidentificationbasedonmachinelearningandtargetgeneinformation.BmcBioinformatics,2018