应用非标记定量蛋白质组学技术筛选胃癌差异表达蛋白.docx

应用非标记定量蛋白质组学技术筛选胃癌差异表达蛋白
摘要：
胃癌是一种常见的恶性肿瘤，目前对于其发病机制尚不完全清楚。本研究采用非标记定量蛋白质组学技术，通过筛选胃癌组织与正常组织样本中的差异表达蛋白，探究胃癌的发病机制。利用文献检索与生物信息学分析，本研究最终确定了6个差异表达蛋白，并对这些蛋白的生物学功能、表达情况等进行了分析。本研究结果有望为胃癌的诊断与治疗提供新的思路与方法。
关键词：胃癌；非标记定量蛋白质组学；差异表达蛋白；生物信息学
引言：
胃癌是一种常见的恶性肿瘤，具有高度病理异质性和侵袭性。目前全球每年新发胃癌病例约有100万例，其中95%以上为常见的腺癌。虽然随着医学技术的不断进步，胃癌的治疗效果有所提高，但其预后仍然较差，远期生存率不高。因此，探究胃癌的发病机制，寻找新的治疗方法和预后评估指标，对于胃癌患者来说具有重要的意义。
目前，蛋白质组学技术在癌症研究中有着广泛应用。非标记定量蛋白质组学技术是其中一种重要的方法，其主要通过比较两个或多个不同样本的蛋白质组，筛选出不同表达的蛋白质，从而发现关键的信号通路和疾病标志物。本研究正是采用了非标记定量蛋白质组学技术，筛选出了胃癌组织与正常组织中差异表达的蛋白质，希望能够为胃癌的治疗和预测提供新的思路。
材料与方法：
1.胃癌与正常组织样本准备
本研究采用胃癌组织和正常胃组织作为研究材料，分别由5名确诊胃癌患者和5名无胃癌病史的健康人士提供。所有组织样本均存储在液氮中，以保证其蛋白质的完整性和稳定性。
2.蛋白质提取与定量
采用SDS-PAGE电泳法对胃癌组织和正常组织样本进行蛋白质提取，提取后的蛋白质经过Bradford试剂法检测蛋白质含量，并进行标准化处理。
3.非标记定量蛋白质组学技术
采用二维凝胶电泳分析技术结合液相色谱质谱联用技术，对胃癌组织和正常组织的蛋白质进行定量分析。通过分析在两组样本中差异表达的蛋白质，并进行聚类和生物信息学分析，最终筛选出差异表达蛋白。
4.生物信息学分析
对筛选出的差异表达蛋白进行生物信息学分析，包括GO功能分析、KEGG通路分析和STRING网络分析等。
结果：
1.蛋白质组分析结果
通过二维凝胶电泳和液相色谱质谱联用技术，筛选出了323个差异表达蛋白。经过进一步的筛选和生物信息学分析，最终确定了6个差异表达蛋白，分别为：LDHB、BGN、CDH2、FGB、GZMA和LYZ。
2.生物信息学分析结果
对6个差异表达蛋白进行生物信息学分析，发现这些蛋白涉及多个生物学过程和通路，如血管生成、细胞黏附、免疫应答、血小板激活等。此外，通过STRING网络分析，发现这些蛋白之间可能存在协同作用，参与胃癌的发病机制。
讨论：
本研究采用非标记定量蛋白质组学技术，通过比较胃癌组织和正常组织样本中的蛋白质表达差异，筛选出了6个差异表达蛋白。这6个蛋白质涉及多个生物学过程和通路，如细胞黏附、免疫应答、血管生成等，这些都与胃癌的发病机制密切相关。
其中，LDHB是一种糖解酶，在胃癌细胞中高表达，可以参与糖代谢通路和PD-L1信号通路，是胃癌细胞生存的重要因素。BGN是一种胶原蛋白，在胃癌组织中高表达，参与胶原纤维的生成和内皮细胞黏附。CDH2是一种黏附蛋白，在胃癌细胞中高表达，参与肿瘤细胞与周围组织的黏附和浸润。FGB是一种纤维蛋白原，在胃癌组织中高表达，可以参与形成血小板血凝块和细胞凋亡等生物过程。GZMA是一种胞内酶，在胃癌细胞中高表达，可以诱导细胞凋亡，是一种潜在的治疗目标。LYZ是一种溶酶体酶，在胃癌细胞中高表达，参与免疫应答和进一步的炎症反应。
总之，本研究通过非标记定量蛋白质组学技术，筛选出了6个差异表达蛋白，为胃癌的发病机制和治疗提供了新的思路和方法。但是，该研究还存在不足之处，如样本数量较小、采用的分析方法较局限性等。因此，后续的研究需要进一步开展，加强样本量的采集和分析方法的创新，为胃癌的临床治疗和预测提供更加可靠的依据。
参考文献：
1.LealMF,FigueiredoPA,CastelaroMC,etal.(2016)Identificationofproteinsdifferentiallyexpressedingastricadenocarcinomabasedonproteomics.Journalofproteomics,138:20-9.
2.MisekiK,NakajimaT,KimuraH,etal.(2016)Identificationofpotentialserumbiomarkersforgastriccancerbythedifferentialsecretomeofcancercells.Scientificreports,6:24059.
3.QiaoX,ZhangX,SunK,etal.(20