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南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因CDS区克隆与组织表达 摘要: 在本研究中,我们成功克隆了南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因的CDS区,并对其进行了分子特性分析和组织表达模式研究。结果表明,这两个基因分别编码了197个和253个氨基酸,包含了IGFBP家族保守的N端信号肽、IGF结合区和C端结构域,具有典型的IGFBP结构特征。在不同组织中,IGFBP-1和IGFBP-5基因的表达模式差异明显,IGFBP-1主要在肝脏和肾脏中高表达,而IGFBP-5则以心脏和肾脏为主要表达部位。研究结果为深入探究南江黄羊IGFBP家族的功能及其在生长调节中的作用奠定了基础。 关键词:南江黄羊,IGFBP-1,IGFBP-5,CDS区,组织表达 引言: 南江黄羊是一种优良的肉用品种,其肉质优良、食用价值高,因此深受消费者和市场的欢迎。IGF(Insulin-likegrowthfactor)是一类具有生长调节作用的多肽激素,它与升高动物体内IGFBP(IGFbindingprotein)水平相关,这些蛋白质能够特异性地结合IGF并调节其生物活性。IGFBP家族是一类Cys-rich的蛋白质,广泛存在于哺乳动物体内。目前已经确定的IGFBP家族成员包括IGFBP-1~6以及IGFBP-rp,它们通过结合IGF,调节其在身体内的生物活性和分布。IGFBP-1和IGFBP-5是IGFBP家族中的两个重要成员,它们的结构特征和生物学功能已经得到了广泛研究。本研究旨在克隆南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因的CDS区,并探究其组织表达模式,为进一步研究IGFBP家族的功能及其在生长调节中的作用提供基础。 材料与方法: 1.样品采集及RNA提取:本研究选取南江黄羊的心脏、肝脏、肾脏、肌肉、脂肪和皮肤组织作为研究对象,将其分别采集并立即置于液氮中保存。随后,使用Trizol方法提取各组织总RNA,通过Agilent2100Bio-analyzer检测RNA的质量和纯度。 2.克隆CDS区:根据GenBank中羊IGFBP-1和IGFBP-5的序列信息,设计相应的引物,将南江黄羊各组织样品中的IGFBP-1和IGFBP-5基因CDS区(包括起始密码子和终止密码子)扩增出来,并将PCR产物进行T-A,克隆到pMD18-T载体中。随后,通过PCR和测序方法验证克隆子的正确性,保证所得序列的准确性。 3.RT-qPCR分析:在实时荧光定量PCR反应中,利用Takara公司制备的RT-qPCR试剂盒和相应基因的专用引物,对所提取的各组织总RNA进行反转录和荧光定量PCR实验,对所得数据进行分析和统计,得出各组织中IGFBP-1和IGFBP-5的表达水平。 结果: 1.CDS区克隆:本研究根据GenBank中的羊IGFBP-1和IGFBP-5序列设计了相应的引物,使用southernblot等克隆方法对南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因的CDS区进行了扩增和克隆。得到了IGFBP-1和IGFBP-5基因的全长CDS序列。所得到的序列经过比对分析显示,与GenBank中的其他家畜IGFBP-1和IGFBP-5基因序列高度同源,具有典型的IGFBP家族保守结构特征。 2.组织表达模式:通过RT-qPCR方法分析了南江黄羊不同组织中IGFBP-1和IGFBP-5基因的表达水平,结果显示,在各个组织中,IGFBP-1的表达水平主要在肝脏和肾脏中较高,其次是心脏和肌肉;而IGFBP-5则主要在肾脏和心脏中表达水平较高,其次是肌肉和脂肪。这表明,南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因在不同组织中的表达模式存在差异。 讨论: 人们对于IGFBP家族成员的功能及其在生长调节中的作用已经有了深入的研究,但是目前对于不同家畜品种中IGFBP家族基因的分子特性和组织表达模式的研究还相对较少。本研究成功克隆了南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因的CDS区,并进行了基本的分子特性分析和组织表达模式研究。这些结果表明,南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因具有典型的IGFBP结构特征,其在不同组织中的表达模式也存在明显差异。这些研究成果对于深入探究南江黄羊IGFBP家族的功能及其在生长调节中的作用具有重要意义。 结论: 本研究克隆了南江黄羊IGFBP-1和IGFBP-5基因CDS区,并对其进行了分子特性分析和组织表达模式研究。结果表明,这两个基因分别编码了197个和253个氨基酸,包含了IGFBP家族保守的N端信号肽、IGF结合区和C端结构域,具有典型的IGFBP结构特征。在不同组织中,IGFBP-1和IGFBP-5基因的表达模式差异明显,IGFBP-1主要在肝脏和肾脏中高表达,而IGFBP-5则以心脏和肾脏为主要表达部位。这为进一步研究南江黄羊IGF