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抗多药耐药菌药物筛选模型的建立与应用的任务书 任务概述: 随着抗生素的广泛应用,多种菌株已经产生了抗药性,这些菌株被称为多药耐药菌(MDR)。由于MDR的存在,医生治疗感染性疾病变得更加困难和昂贵,因此寻找新型的抗生素治疗方法是非常必要的。为此,本任务书旨在建立抗多药耐药菌药物筛选模型,并且将其应用于对不同菌株进行筛选。 任务要求: 1.了解反应表达数据分析方法以及机器学习模型。 2.收集医院内部的菌株样本数据,构建菌株药物反应数据集 3.使用机器学习算法进行数据分析,建立抗多药耐药菌药物筛选模型。 4.对模型进行测试和优化,并得到满意的结果。 5.根据结果,给出药物治疗意见,并归纳总结模型的优缺点。 6.提出未来方向,如如何改进模型精度、增加数据集的数量等。 任务分解: 任务1:反应表达数据分析方法 了解反应表达数据分析方法,学习机器学习算法的基础知识,熟悉常用的数据分析工具。 任务2:菌株药物反应数据集构建 收集医院中的菌株样本数据,对数据进行预处理和清洗,构建菌株药物反应数据集。 任务3:机器学习算法的建立 运用机器学习算法,建立抗多药耐药菌药物筛选模型。包括模型训练,选择合适的算法,设计特征选择方案,建立模型的评估自动化和模型的优化等。 任务4:模型测试和优化 测试和优化模型,将模型应用于实际的菌株数据中,评估模型在新数据集中的表现,探索如何提高模型的准确度和效率。 任务5:药物治疗意见的提出 根据模型结果,给出药物治疗意见,这是很重要的,因为这样可以为临床医生提供准确、高效的治疗方案。 任务6:总结和未来方向 总结抗多药耐药菌药物筛选模型的优缺点,提出未来可能的改进方向,分析并讨论有哪些方面的研究值得深入探究。 参考文献: 1.徐宏昭.反应表达数据分析方法前沿进展[J].控制理论与应用,2016,33(11):1376-1382. 2.唐炳琳.机器学习方法在药物发现中的应用[J].中国药理学通报,2018,34(09):1165-1172. 3.许建清,李诚,程建平.基于机器学习的药物筛选模型研究进展[J].药学研究,2017,34(01):15-22. 4.张启文.机器学习在生物信息学中的应用[J].数据分析与知识发现,2017,1(9):1-15. 5.丁明,康乐.结合特征选择和机器学习的抗多药耐药菌临床分类研究[J].云南医学,2016,37(09):1136-1139. 6.徐桂花,李园,杨文利等.机器学习在肿瘤领域中的应用[J].中国生物医学工程学报,2017,36(03):352-360.