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稻瘟菌定殖与扩展过程中特异表达基因分析的任务书 任务书 任务名称:稻瘟菌定殖与扩展过程中特异表达基因分析 任务描述: 稻瘟菌是一种严重影响水稻和其他禾本科作物产量和质量的病原真菌。在稻瘟菌定殖和扩展过程中,特异表达的基因起着重要的作用。本任务旨在对稻瘟菌定殖和扩展过程中特异表达的基因进行分析,以提高我们对该菌的认识,有助于控制和治疗稻瘟病。 任务要求: 1.研究稻瘟菌在定殖和扩展过程中特异表达的基因; 2.分析这些基因的生物学功能、代谢通路和调控机制等方面的信息; 3.深入讨论这些基因与稻瘟病的致病机理之间的关系; 4.基于这些分析结果,提出针对稻瘟病治疗和防控的新思路和策略。 任务步骤: 1.收集稻瘟菌样品,提取RNA并制备cDNA文库。 2.应用高通量测序技术,对稻瘟菌在定殖和扩展过程中的相对基因表达进行定量分析。同时,利用生物信息学工具,对这些基因进行功能注释、代谢通路预测和调控元件预测等分析。 3.对分析结果进行统计学分析和生物信息学分析。按照相对表达量分布和参考基因组注释结果,确定差异表达基因的信息。 4.将差异表达基因进行TEM验证,观察基因的表达情况和鉴定其表皮淬灭性。 5.将不同表达基因进行功能鉴定,通过酶学分析等方法研究其生物学功能。 6.探讨差异表达基因与稻瘟病的致病机理之间的关系,如根据氧化还原反应调控等机制。 7.基于分析结果,提出针对稻瘟病的治疗和防控新思路和策略。 8.撰写分析报告,并进行实验结果与科学家和专家的讨论和审查。 参考文献: 1.NallewegheA.,VolfP.,KooymanF.N.J.,DolinskaM.B.,BakkerenG.,VanWestP.,etal.(2020)Theeffectofphysicalbarriersandsurfacesonthehyphalcontactsensingandnetformationofsoil-borneplantpathogens.TheISMEJournal,14:1149–1159. 2.GohJ.,JeongY.,ParkJ.W.,etal.(2019)IdentificationofasecretedproteinofMagnaportheoryzaethatisinvolvedintherice-leafblastpathosystem.PlantPathologyJournal,35:558–567. 3.WangY.,SunX.,JinC.,HouH.,etal.(2019)AMagnaportheoryzaeeffectorprotein,AVR-Pik,targetsthericeRINGE3ubiquitinligaseOsRMCtopromotepathogenvirulence.PLoSPathogens,15:e1007742. 4.Sánchez-ValletA.,RamosB.,SalesE.,etal.(2018)Magnaportheoryzaezinc-fingertranscriptionfactorMZnF2isrequiredforriceblastdisease.MolecularPlantPathology,19:1255–1268.