长链非编码RNA lncATV参与宿主抗病毒机制的研究的任务书.docx

长链非编码RNAlncATV参与宿主抗病毒机制的研究的任务书
任务书
一、背景介绍
长链非编码RNA（lncRNA）是一类RNA分子，其长度通常超过200个核苷酸，不编码蛋白质。与传统的mRNA不同，lncRNA在表达、调控细胞生理和病理过程中扮演重要角色。研究表明，lncRNA参与细胞分化、发育、代谢、凋亡、免疫等重要生理过程。在宿主抗病毒机制中，一些lncRNA表现出了调控病毒感染的重要作用。lncRNA对病毒复制、病毒感染后的宿主细胞生理过程调控和免疫应答等方面起到了关键性作用。
ATV（Aviantumorvirus）是禽类肿瘤病毒，该病毒具有明显的致癌能力，已在禽类不同品种中发现过。以往的研究表明，ATV感染后能够抑制宿主细胞的免疫应答，这是病毒引起感染和致病的主要原因之一。但目前关于lncRNA在ATV感染后宿主抗病毒机制中的作用尚不清楚。
本次研究旨在探究ATV感染后宿主细胞中的lncRNA表达变化和作用，发现并鉴定潜在的ATV感染抑制性lncRNA，揭示lncRNA参与ATV感染后宿主抗病毒机制的分子机制，为深入理解宿主抵抗ATV感染的分子机制提供理论依据和实验基础。
二、研究目的
1.分析ATV感染后宿主细胞中的lncRNA表达谱变化。
2.筛选ATV感染后具有抗病毒活性的lncRNA，并验证其功能。
3.鉴定ATV感染后参与宿主抗病毒机制的lncRNA靶基因列表。
4.分析ATV感染后lncRNA-mRNA网络，揭示它们在感染后宿主抗病毒机制中的作用机制。
三、研究内容及方法
1.ATV感染细胞系构建
采用ATV感染细胞模型，通过PCR扩增ATV基因组，构建重组腺病毒载体，以A549细胞系为主要细胞株，构建ATV感染细胞系。
2.分析ATV感染后宿主细胞中lncRNA表达谱变化
将ATV感染后A549细胞和未感染的对照组细胞样本进行RNA测序，通过差异表达分析，筛选出显著差异lncRNA。
3.鉴定ATV感染后具有抗病毒活性的lncRNA，并验证其功能
采用RNA干扰技术，敲低感染后与对照组差异显著的lncRNA，通过实验验证，在相关lncRNA敲低的细胞中检测ATV病毒复制情况，以此确认具有抗病毒活性的lncRNA，筛选出与ATV感染对抗的有效lncRNA。
4.鉴定ATV感染后参与宿主抗病毒机制的lncRNA靶基因列表
使用深度测序与生物信息学分析技术，鉴定分析lncRNA靶基因，进一步阐明识别有效lncRNA及其靶标对ATV感染后宿主抗病毒机制的调控作用。
5.分析ATV感染后lncRNA-mRNA网络
通过lncRNA靶基因列表，鉴定分析ATV感染后lncRNA-mRNA调控网络，包括各成员之间的互作，以及对整个ATV感染后宿主抗病毒机制的重要性。。
四、预期成果
1.确定ATV感染后A549细胞中lncRNA表达谱变化，并鉴定出与ATV感染有关的lncRNA基因。
2.从ATV感染后A549细胞中鉴定出具有抗病毒作用的lncRNA基因，并验证其功能。
3.鉴定ATV感染后参与宿主抗病毒机制的lncRNA靶基因列表。
4.分析ATV感染后lncRNA-mRNA调控网络，阐明lncRNA在ATV感染后宿主抗病毒机制中的作用机制。
五、时间安排
第一年
1.构建ATV感染细胞系（2个月）
2.分析ATV感染后宿主细胞中lncRNA表达谱变化，筛选出显著差异lncRNA（4个月）
第二年
3.筛选并验证具有抗病毒活性的lncRNA，鉴定其靶基因列表（6个月）
第三年
4.分析ATV感染后lncRNA-mRNA调控网络，阐明lncRNA在ATV感染后宿主抗病毒机制中的作用机制（6个月）
六、研究经费预算
本研究经费预算为30万元人民币，主要用于实验器材设备和试剂购买、细胞培养和动物实验费用、实验人员工资和差旅费用等，具体预算如下：
1.试剂和材料费：15万元
2.实验仪器和设备费：5万元
3.工资费：7万元
4.差旅费用：3万元
总计：30万元。
七、研究团队
本次研究由主要研究者和研究团队组成。主要研究者是****，担任实验设计、数据解读和论文撰写等工作；研究团队包括完成实验和数据分析的研究人员和科研助理等。团队将充分发挥各自的优势，共同完成研究任务。
八、研究意义
本研究将全面探究在ATV感染后宿主细胞中lncRNA的表达变化、特定的lncRNA在抗病毒中的作用和mechanism，揭示ATV感染后宿主细胞中的抗病毒机制以及长链非编码RNA在其中的作用。通过鉴定ATV感染后具有抗病毒活性的lncRNA，并验证其功能，有可能为以后疾病防治提供新的研究思路和实验依据。