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猪早期闭锁卵泡基因表达芯片分析的任务书
任务书：
课题标题：猪早期闭锁卵泡基因表达芯片分析
任务目的：
本次研究旨在通过基因芯片技术，分析猪早期闭锁卵泡的基因表达情况，探究关键基因调控网络及其在卵母细胞发育过程中的作用，为猪制定合理的产业化育种方案提供理论依据。
任务内容：
1.对猪闭锁卵泡样本进行采集、处理、RNA提取、反转录、标记和杂交等处理，获取高质量富含全基因表达信息的芯片数据。
2.分析基因芯片数据，运用不同的生物信息学方法，挑选有意义的基因，探究猪闭锁卵泡中关键基因的表达变化及其在卵母细胞发育过程中的作用。
3.系统评估发现的关键调控基因网络和相互作用模式，提出研究假说并进行验证实验。
4.通过研究，了解关键基因在猪卵母细胞发育过程中的作用，探讨途径，为猪育种提供科学依据和理论支持。
任务要求：
1.详细设计实验方法，包括芯片数据的采集和处理、基因表达数据的预处理、差异基因筛选和功能注释等步骤。
2.充分利用当前的生物信息学工具分析基因表达数据，挖掘出富有生物学意义的差异表达基因和通路。
3.选择有代表性的差异表达基因，筛选关键调控基因，设计验证实验，探讨其在卵母细胞发育过程中的作用，了解表达调控机制。
4.撰写论文撰写，内容不低于1200字，并报告研究过程和发现，包括实验设计，数据分析和结果解释。文章格式规范，语言准确，图表清晰。
5.高度重视研究过程中的生物安全，确保实验室操作符合安全规范。
任务周期：
本课题计划周期为3个月，具体计划如下:
第一周：确定研究计划，设计具体实验方案。
第2-3周：采集样本，RNA提取和标记等处理，确保数据的质量。
第4-6周：进行基因芯片数据分析，挖掘差异表达基因，注释功能。
第7-8周：筛选关键调控基因，设计验证实验。
第9-10周：进行关键基因功能验证实验，探讨表达调控机制。
第11-12周：撰写论文，并准备相关科研报告。
任务分工：
1.实验设计：A同学
2.样本采集和处理：B同学
3.基因芯片数据分析：C同学
4.关键基因筛选和验证实验：D同学
5.论文撰写和科研报告：ABCD同学共同完成。
参考文献：
1.Jiang,J.,Wang,B.,Li,M.,etal.(2017).Transcriptomeanalysisofovarianfolliclesrevealstheimportanceofcalciumsignalingpathwaysinthemaintenanceoffolliculardevelopmentinpigs.BiologyofReproduction,96(1),182-193.
2.Liang,Y.,Chen,X.,Yan,T.,etal.(2018).GlobalanalysisoflongnoncodingRNAexpressioninporcinegranulosacellsafterfollicle-stimulatinghormonestimulation.JournalofAnimalScienceandBiotechnology,9(1),6.
3.Sousa,B.,Rovira,M.,Gallardo,D.,etal.(2017).Transcriptionalprofilingofporcineovarianfolliclesatdifferentstagesofdevelopment.BMCGenomics,18(1),90.