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食管鳞状细胞癌代谢组学研究及天冬酰胺合成酶在食管鳞状细胞癌中的功能研究的任务书 一、研究背景与意义 食管鳞状细胞癌是中国东北地区常见的恶性肿瘤之一,它的发病率逐年上升。虽然在临床上已经有了针对食管鳞状细胞癌的一些治疗方法,但是很多治疗方案的疗效并不理想。因此,探究食管鳞状细胞癌的发病机制以及代谢组学特征,对于制定更为有效的治疗策略具有非常重要的意义。 天冬酰胺合成酶(ASNS)作为一种关键酶,在食管癌细胞的代谢过程中起着比较重要的作用。因此,深入了解ASNS在食管鳞状细胞癌中的功能意义,将为治疗食管鳞状细胞癌提供理论依据。 二、研究内容及方法 研究内容: 1、分析食管鳞状细胞癌患者的代谢组学特点,探究与其发病发展的关系; 2、评估天冬酰胺合成酶在食管鳞状细胞癌中的表达水平,探究其在食管鳞状细胞癌发生发展过程中的意义; 3、通过干扰ASNS表达水平的方法,验证ASNS在食管鳞状细胞癌中的功能。 研究方法: 1、收集食管鳞状细胞癌患者和对照组正常人的血清样本,进行相应的代谢组学分析,并针对不同代谢物进行生化分析和基因测序分析。 2、通过组织芯片及组织病理学分析等方法,比较ASNS在食管鳞状细胞癌和对照组正常组织中的表达水平。 3、在细胞水平上,通过CRISPR-Cas9基因编辑技术形成ASNS基因敲除的人巨细胞瘤细胞系,研究ASNS在细胞的生长和代谢过程中的功能,并探讨ASNS在细胞中其他代谢途径的调节作用以及是否与其它癌症相关基因表达存在相关性。 三、研究预期结果 通过上述研究方法,预期可以得到以下结果: 1、明确食管鳞状细胞癌患者的代谢组学特征,以及从代谢层面解释其发病的机制; 2、评估ASNS在食管鳞状细胞癌中的表达水平,建立ASNS在食管鳞状细胞癌中的调节作用模型; 3、利用ASNS的基因敲除技术,验证ASNS在食管鳞状细胞癌中的功能,为治疗食管鳞状细胞癌提供理论依据。 四、研究经费 本研究经费预计需要200万以上,主要用于购买仪器设备、人员费用和实验耗材等方面。其中,设备费约占70%左右。 五、研究周期 本研究预计需要三年时间完成,每年设置不同的研究阶段和任务节点,详细来说如下: 第一年:收集血清和组织标本,分离组织RNA和基因测序分析,以及细胞组织培养和细胞系建立。 第二年:代谢组学数据分析和初步研究结果探讨,目标基因ASNS的表达和功能研究。 第三年:在第二年基础上,完成目标基因ASNS的调控机制研究,并进行结果的整理和论文撰写。 六、参考文献 1.SerkovaNJ,StandifordTJ,StringerKA.TheEmergingFieldofQuantitativeBloodMetabolomicsforBiomarkerDiscoveryinCriticalCareMedicine[J].Americanjournalofrespiratoryandcriticalcaremedicine.2017,195(10):1399-1408. 2.DuttaP,LeA.MetabolicReprogrammingofCancerCellsandItsTherapeuticImplications[J].Ajp.Gastrointestinalandliverphysiology.2016,310(9):G697-G712. 3.ZhangY,ShiRui,ZhangY,et.al.Theroleofasparaginesynthetaseintumorigenesisandcancertherapy[J].Europeanjournalofpharmacology.2020,875:172931. 4.JeonYongtae,KimYongha,LeeSijeong,et.al.EvaluationoftheAssociationbetweenAsparagineSynthetaseExpressionandPrognosisinGastricCancer[J].JournalofGastricCancer.2018,18(1):64-76. 5.KimHyunjin,KimTaesung,KimJongwon,et.al.AsparagineSynthetaseOverexpressionandItsPotentialAssociationwithLymphangiogenesisandLymphNodeMetastasisinHeadandNeckSquamouscellCarcinoma[J].Cancerresearchandtreatment:officialjournalofKoreanCancerAssociation.2016,48(2):407-419.