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马铃薯体细胞杂种的染色体组成研究及结薯相关差异表达基因的分析的任务书 任务书 题目:马铃薯体细胞杂种的染色体组成研究及结薯相关差异表达基因的分析 任务背景: 马铃薯是一种重要的全球性粮食作物,其地下块茎富含碳水化合物、维生素和矿物质等多种营养物质,是人类食物和饲料的重要来源。然而,马铃薯品种的遗传多样性有限,而且存在一些生物技术难题,如利用传统的杂交育种技术获得新品种的难度较大,同时也有很多疾病的发生,降低了产量和品质。整合基因组学技术和细胞生物学技术,研究马铃薯体细胞杂种的染色体组成及其与结薯的相关差异表达基因,对马铃薯的育种及其产业化发展具有重要指导意义。 任务目标: 本任务的主要目标是通过对马铃薯体细胞杂种的染色体组成进行研究,结合RNA测序技术,鉴定对结薯相关的差异表达基因,并分析其作用机制,为马铃薯的遗传改良和功能研究提供基础数据。 任务内容: 1.对马铃薯体细胞杂种的染色体组成进行研究,利用荧光原位杂交技术分析染色体数量和结构的变化。 2.通过RNA测序技术,对马铃薯体细胞杂种中的差异表达基因进行鉴定和筛选。 3.利用生物信息学技术对筛选出的差异表达基因进行GO和KEGG通路分析,挖掘与结薯相关的生物学过程和分子机制。 4.通过qRT-PCR技术对产生差异表达的关键基因进行验证,确定其在结薯过程中的作用机制。 任务计划: 阶段1(1月):查阅相关文献并了解研究对象的基本情况,确定研究方法和技术路线。 阶段2(2-4月):收集和制备马铃薯体细胞杂种样品,通过荧光原位杂交技术分析染色体组成。 阶段3(5-8月):利用RNA测序技术对样品进行测序,鉴定和筛选出差异表达基因,并进行生物信息学分析。 阶段4(9-11月):利用qRT-PCR技术对差异表达基因进行验证,并确定其在结薯过程中的作用机制。 阶段5(12月):撰写任务报告并提交。 任务要求: 1.具备分子生物学基础知识,熟悉荧光原位杂交、RNA测序和qRT-PCR等相关技术。 2.具备生物信息学基础知识,熟练运用生物信息学软件进行数据处理和分析。 3.按计划完成任务,并在规定时间内撰写完整、准确的任务报告。 4.注意科学实验的安全性,遵守实验室管理规定。 参考文献: 1.BassilN,DavisTM,ZhangH,etal.Developmentandpreliminaryevaluationofa90KAxiomSNParrayfortheallo-octoploidcultivatedstrawberryFragaria×ananassa.BMCGenomics.2015;16:155. 2.LiG,QuirosCF.Inplantaside-chainglucosinolatemodificationinArabidopsisbyintroductionofdioxygenaseBrassicahomologBoGSL-ALK.TheorApplGenet.2003;106(7):1116-1121. 3.LiG,QuirosCF.Single-copygenesasmolecularmarkersforphylogenomicstudiesintheBrassicaceae.JMolEvol.2001;52(5):446-53.