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菊属及其近缘属植物遗传多样性及亲缘关系初步研究的任务书 一、研究背景及意义 菊属(Aster)是菊科(Asteraceae)中的一属,包含了大约600种。菊属的植物广泛分布于全球各地,具有重要的经济和生态价值。许多菊属植物被用作观赏植物、药用植物、食用植物、染料植物和工业原材料等。菊属植物还具有重要的环境、生态和生物学意义,是一些生态系统和生态环境的重要组成部分。 菊属植物具有较高的遗传多样性,不同的品种和种群具有不同的遗传特征和遗传变异程度。对菊属植物的遗传多样性和亲缘关系的研究,可以为菊属植物的分类学、系统发育、遗传改良和保护等方面提供基础性的数据和信息。研究菊属及其近缘属植物的遗传多样性和亲缘关系,不仅有助于深入了解这些植物的生态和生物学特征,还能为菊属植物的保护和利用提供科学依据和技术支持。因此,开展菊属及其近缘属植物遗传多样性及亲缘关系的研究,具有重要的科学意义和实践价值。 二、研究目的和内容 研究目的:通过研究菊属及其近缘属植物的遗传多样性和亲缘关系,揭示这些植物的遗传结构、演化历史和种群分化模式,为菊属植物的分类学、系统发育、遗传改良和保护等方面提供基础性的数据和信息。 研究内容: 1.采集和鉴定研究样本,包括菊属和一些近缘属植物,比较分析它们之间的形态和生物学特征,筛选出具有遗传多样性和亲缘关系代表性的样本。 2.通过分子生物学技术分析研究样本的遗传多样性,包括DNA多态性分析和DNA序列分析等方法。运用RAPD、ISSR、SSR等分子标记技术,分析研究样本的基因型和等位基因频率,计算遗传多样性指标,比较不同品种和种群的遗传多样性和遗传变异程度。 3.利用分子系统发育学方法,分析研究样本的亲缘关系和演化历史,包括构建系统发育树、计算遗传距离和聚类分析等方法。通过分析研究样本的DNA序列差异和分歧,揭示不同种间和种内的遗传关系和遗传演化历史。 4.结合形态学和生物学特征,分析研究样本的适应性进化和种群分化模式,比较不同品种和种群的生态适应性和遗传分化程度。 三、研究方法和技术路线 1.采集和鉴定研究样本:采集菊属和近缘属植物的叶片、茎、花蕾等组织样本,进行形态学和生物学特征的比较分析;利用植物分类学和系统学的方法对鉴定结果进行确认,并筛选出具有代表性的样本。 2.DNA多态性分析:利用RAPD、ISSR、SSR等PCR技术,分析不同样本的DNA多态性,计算遗传多样性指标如遗传多样性、等位基因数目、基因型频率、PIC值等。 3.DNA序列分析:利用PCR扩增和测序技术,得到样本的DNA序列,并比较序列差异和分歧,测定不同种间和种内的遗传距离和遗传关系,构建系统发育树。 4.适应性进化和种群分化分析:结合形态学和生物学特征,分析不同品种和种群的适应性进化和种群分化模式,比较不同品种和种群在基因、形态和生理等方面的差异和相似性。 技术路线:样本采集和鉴定→DNA多态性分析→DNA序列分析→适应性进化和种群分化分析→研究结果和讨论。 四、研究计划和预期成果 1.研究计划 (1)样本采集和鉴定时间:3个月 采集菊属和近缘属植物样本,进行形态学和生物学特征比较分析,确定具有代表性的样本。 (2)DNA多态性分析时间:6个月 使用RAPD、ISSR、SSR等分子标记技术,分析不同样本的遗传多样性和等位基因频率,计算遗传多样性指标,比较不同品种和种群的遗传多样性和遗传变异程度。 (3)DNA序列分析时间:6个月 利用PCR扩增和测序技术,测定样本的DNA序列,比较序列差异和分歧,测定不同种间和种内的遗传距离和遗传关系,构建系统发育树。 (4)适应性进化和种群分化分析时间:3个月 结合形态学和生物学特征,分析不同品种和种群的适应性进化和种群分化模式,比较不同品种和种群在基因、形态和生理等方面的差异和相似性。 2.预期成果 (1)建立菊属及其近缘属植物的遗传多样性数据库,包含不同品种和种群的遗传多样性和等位基因频率等数据。 (2)揭示菊属及其近缘属植物的遗传多样性和亲缘关系,明确它们的种群分化历史和演化模式。 (3)为菊属植物的分类学、系统发育、种质资源保护和遗传改良等方面提供基础性数据和信息。 (4)为菊属及其近缘属植物的利用和保护提供科学依据和技术支持。