干旱胁迫抑制高羊茅分蘖发育的分子机理的任务书.docx

干旱胁迫抑制高羊茅分蘖发育的分子机理的任务书
任务书
题目：干旱胁迫抑制高羊茅分蘖发育的分子机理
任务背景：
高羊茅（FestucaarundinaceaSchreb.）是优质牧草之一，被广泛应用于草地建设和畜牧业中。然而，在干旱条件下，高羊茅生长受到严重抑制，导致产量降低和草地生态系统的破坏。干旱胁迫对高羊茅分蘖发育的影响，是影响高羊茅干旱适应性的重要因素，但分子机理尚不清楚。因此，研究干旱胁迫抑制高羊茅分蘖发育的分子机理，对于深入理解高羊茅干旱适应性的调控机制，提高高羊茅的干旱适应性，具有重要科学意义和应用价值。
任务目标：
本研究旨在探究干旱胁迫条件下，高羊茅分蘖发育受到抑制的分子机理，明确分子调控网络及关键基因的作用机制，为高羊茅干旱适应性调控机制的研究提供新的理论基础。
任务内容：
1.建立干旱胁迫模型
（1）选取同龄高羊茅苗作为材料，分别于几个不同的干旱处理条件下进行培养。
（2）测量干旱处理过程中高羊茅器官形态指标、生理生化指标的变化规律。
2.基于转录组测序技术，筛选差异表达基因
（1）提取高羊茅组织总RNA，构建RNA-seq文库并测序。
（2）使用TopHat和Bowtie软件包比对测序数据，并通过Cufflinks软件包进行转录本组装和定量分析，筛选出差异表达的基因。
3.对差异表达基因进行功能富集分析
（1）对差异表达基因进行KEGG、GO等功能分类和富集分析。
（2）筛选出与分蘖发育相关的基因，进一步确定调控网络和主要信号通路。
4.筛选关键基因并进行验证
（1）通过qPCR验证差异表达基因结果，筛选出影响高羊茅分蘖发育的关键基因。
（2）进一步研究关键基因的功能和作用机制，探究其对于高羊茅干旱适应性的调控作用。
任务进度：
任务开始时间：2021年9月1日
任务结束时间：2022年8月31日
阶段时间节点主要任务
第一阶段2021年9月-11月搭建干旱胁迫模型并测量高羊茅各项指标
第二阶段2021年11月-2022年2月RNA-seq测序并比对
第三阶段2022年2月-5月差异表达基因功能分析
第四阶段2022年6月-8月关键基因筛选、验证及功能分析
任务要求：
1.按照任务计划，按时保质保量完成任务。
2.认真阅读相关文献，准确把握研究背景和目标，以及研究思路和方法。
3.熟练掌握RNA-seq测序技术和差异表达分析的基本操作，具有较强的技术能力和实验操作能力。
4.熟练运用生物信息学工具对测序数据进行处理和分析，具有一定的数据处理和分析能力。
5.独立完成科研论文写作，能够撰写高质量的科研报告。